「特集」として不定期に、ロケでのレポートや過去の振り返りをメインにした週が放送される。途中に挟まれるキャッチや本編の振り返り以外は全編実写である。1週・5話分で一纏まりの構成になっている。

番組サイドが通常週をレギュラーシリーズと考えているため、特集週の翌週再放送は行われていなかった。2011年度の「特集11」と「特集13」以降からは翌週に再放送をしている。

また、たまに通常週のアニメパートで特集週での出来事を語る時がある。

通常週（翌週の再放送を含む）と特集週以外の週は、同一年度の過去の通常週及び特集週をアンコール放送として再放送されている。2009年度は一部祝日の午前中に通常週を1週間 - 2週間分を特別番組として再放送した事があった。

但し、通常週・特集週ともに下記に該当する場合のアンコール放送は行われない。

• 通常週…3月放送分及びクリスマス関連
• 特集週…年度末に近い回（「特集5」と「特集10」）及び例外扱いで翌週再放送を行った場合（「特集11」と「特集13」）

また、夏の高校野球開催時や年末年始、及び3月下旬の年度末についてはセレクションと称して複数の通常週の内容から選定して1週に纏めて放送している。この場合、金曜放送分は放送されない。

アンコール放送やセレクションは原則上記の通りであるが、2009年度には金曜放送分を連続して再放送した週があった他、2010年12月31日に1時間の特別番組として放送したときには、前半3本が2009年度放送分、後半3本が2010年度放送分からセレクションして放送されていた。

まいんは、アイドルを目指している小学五年生で、夢見がちが玉にキズの女の子。長かったレッスン期間も終わってやってきたデビューの日、初めての歌番組で、そのひらめきから歌詞を間違えて大失敗し、歌番組への出演を禁止されてしまう。そこで、事務所のゆりあ社長から新番組「クッキンアイドル」のオーディションへの参加を薦められ、その会場で食の妖精ミサンガと出会う。ミサンガは、その姿を見ることが出来る人間とパートナーになって、食卓を楽しく豊かにするために、妖精NPOからやってきた妖精だった。オーディションでも変なひらめきが浮かんだまいんだったが、オーディションは合格、まいんは無事にクッキンアイドルになった。

天才的な発想によって直前で料理を変えたりするわがままプロデューサー、番組の収録を邪魔しようとする同じ事務所のみちか、イタリアからやってきたアンジー、同じ事務所のやすのしんを追ってきたやすのしんの幼なじみのきなこ、みちかの家族など、様々な人との出会い。そして、番組内で起こる様々なピンチや、まいんのパパにミサンガの存在がバレそうになるなどの事件。そのような様々な出来事を、まいんのひらめきとミサンガの助けで乗り切っていき、事務所の仲間や家族など周囲の助けを通して、まいんは成長していく。

そんな中突然、妖精NPOのリーダーが現れ、失敗の多いまいんはミサンガのパートナーに相応しくないとして、まいんをテストしようとする。ミサンガが手助けをしないというのが条件だったが、理由も知らずミサンガの助けがないまいんは料理が出来ずに失敗を繰り返し、それを助けようとミサンガが手助けをしたために、テストは不合格になる。しかし、まいんのリーダーへの説得によって、まいんがミサンガのパートナーに相応しいことを証明するため再度テストを受けることを許され、テストに合格。リーダーはミサンガに、「お前はまだ半人前だから、パートナーと助け合うことを忘れるな」、と伝えるのだった。

まいんのライバルである姫小路レイアが、クッキンアイドルのライバル番組に当たるキッチンクイーンという番組を始めた。まいんとレイアは、過去に新人アイドルコンテストやフレッシュスターフェスティバルで一緒になるという縁があった。キッチンクイーンの人気が出たために、まいんはレイアと料理対決をすることになった。料理対決の直前、レイアは料理対決が怖くなって街に来たところで偶然まいんに出会い、一緒に行動することでまいんとレイアの距離が縮まる。料理対決は2人とも満点の引き分けに終わったが、レイアは、料理とは美味しく完璧に仕上げればそれで終わりと思っていたがまいんにとっては食べた人の笑顔を見るまでが料理なのだと気づき、まいんを永遠のライバルと認め、パリに料理修行に旅立つ。その後、クリスマスに一時帰国していたレイアは偶然にまいんと再び出会い、まいんの家に招待されることでさらに交流が深まるのだった。

まいんによって、食卓に灯りが広がり、妖精界から次々とパートナー妖精が降りてきた。まいんが全国ツアーに出たときに大阪で出会った天王寺蘭子にはスカラベが、長崎で出会った麗麗にはアンバーがパートナーについた。アンジーのパートナーにはフロッグがついた。また、ちびっ子妖精クリケットが勝手に地上にやってきた。クリケットは、最初は得意の変身で帰りたくないと暴れていたが、一目ぼれしたゆまのそばにいたいと人間界で修行をした結果、最終的にゆまのパートナーになった。

番組二周年を記念して、おおばやしプロデューサーがクッキンアイドルスペシャルという生放送を企画する。まいんが三組の強敵と対決するという企画だったが、実際は、マザースプリングによる妖精パートナー卒業テストだった。まいんはテストに合格したが、それによって役目を終えたミサンガはまいんと引き離されてしまい、まいんは妖精が見えなくなってしまう。悲しい気持ちで料理が出来なくなってしまったまいんの前に、レイアが現れ、レイアのパートナーとなったスワローから話を聞いたこと、料理が大好きで料理を心から楽しんでいるまいんの気持ちがみんなに広がっていたこと、ミサンガはそんなまいんが大好きだっただろうことを伝える。レイアの言葉に励まされたまいんは、クッキンアイドルとして食卓に明かりを灯し続ける決意をする。クッキンアイドルを観ている子供たちに料理が楽しいという気持ちが広がっていることを知ったミサンガは、やはりまいんのそばにいたいと、リーダーの行っても無駄だという忠告を振り切って妖精界を飛び出す。まいんとミサンガの二人の絆は妖精界の定めを乗り越えて、再び一緒になる。それをリーダーと一緒に妖精界から見ていたマザースプリングは「二人にはまだ果たすべき役割があるのかもしれません。」と言うのだった。

ゆりあ社長の結婚によりスリースターズタレント事務所は解散することになり、まいんは新しい事務所プロダクションよつばに移ることになった。そこで、まいんはひなに出会う。そこで突然現れたおおばやしプロデューサーに言われて、まいんはひなと一緒にクッキンアイドルをすることになる。チーフマネージャーはたけやまの厳しい指摘や同じ事務所の先輩であるアイドルグループ「POP」の妨害にもめげず、かつての事務所の仲間達や同じく事務所で出会った主事さんに支えられながらまいんは頑張るのだった。遂にまいんの真心はPOPの3人にも通じ、和解に至る。

ある日突然、アメリカショービジネス界のカリスマプロデューサー、デビッド・シルクハットが来日する。彼はまいんのクッキンアイドルとしての活躍を目にして、まいんにクッキンアイドルワールドツアーのオファーをするためにやってきたのだ。ワールドツアーと日本のクッキンアイドルの仕事は両立出来ない。まいんは「世界の食卓に明かりを灯す」使命のために一度はワールドツアーを受けるが、「まるでサーカス」（総集編でのミサンガの解説）のようなシルクハットのショーと自分の目指すところが違うことを悟り、ワールドツアーを辞退し日本でクッキンアイドルを続けることにする。シルクハットもそれを快諾するのだった。

「クッキンアイドル」のスタジオが大幅にリニューアルされ、ひなは自身の番組の放送が決定。またPOPには多くの仕事が舞い込むようになり、よつばプロダクションにとって良い出来事が続く。そんなある日まいんはひなの新番組の見学に行くが、そこで彼女が見たのは料理が嫌いになってしまったひなの姿だった。直後、まいんとミサンガの前にマザースプリングが現れ、世界各地で同様の事件が多発していると2人に告げる。更に、雑誌の取材を受けていたパパイヤには突然食欲が無くなるという異変が発生。これらの事件を解決していく内、まいんとミサンガはその犯人が三匹の妖精であると突き止める。食の妖精とは異なる姿を持つ彼女らは、自らを「キラキラ」「マズマズ」「メンメン」と名乗り、子供達を食べ物嫌いにするために人間界にやってきたという。まいんとミサンガの活躍によって、それらの悪行は阻止されるも、ミサンガに一目惚れしたキラキラはそのパートナーであるまいんに深く嫉妬し、本来の目的も忘れてまいんの活動を妨害するようになるが、まいんとミサンガの力には及ばず撃退されていく。まいんとミサンガは三妖精が食べ物を粗末にする子供達に失望して悪事を働いていたことを知り、三妖精も何時しかまいんとミサンガに感化されて料理作りを楽しむようになり、子供たちへの見方も改めていくようになった。まいんは仕事で海外に旅立つことになったみちかや一人前のクッキンアイドルになったことで見えなくなったミサンガとの別れも乗り越えて、クッキンアイドルとしての活動を今日も続けていく。

なお、最終回の最後の挨拶の部分でまいんがクッキンアイドルの卒業宣言をして番組を締めくくっている。

作中番組『クッキンアイドル』のパート、及び金曜日のスタジオセットの部分は実写で行われる。アニメでまいんを演じる福原は実写パートでまいんに扮し、実際に料理に挑戦する。『クッキンアイドル』のパートはストーリー進行上、アニメパートと繋がっている。歌とダンスは別セットの場合がある。実写パートの出演者の名前は金曜日のエンディングにのみクレジットがなされる。

メインの登場人物

柊まいん

演：福原遥
スタジオセットでの料理および歌とダンスを行う。演じる福原は左利きだが、包丁などの道具は全て右手で使っている。
『クッキンアイドル』での最初の挨拶は、「はーい!おいしい料理で、みんな〜ハピハピハッピ〜♥」。料理を作ったあとは「みんなも作ってア・ラ・モード♥」の決め言葉とともにポーズを付けて締める。また、料理に掛かる前に「レッツクッキン」と言葉を掛ける場合もある。また、初年度お弁当の回から、ポイントとなる箇所の決め言葉として「ここでポイント。チェック!チェック!」を使っていた。2012年からは、「ここでまいんのクッキンポイント」を導入。特集回では「がんばりまい〜ん」「ハッピハッピアンサ〜」も使う。2012年度から、料理の時間経過を伝える際に腕時計が光って「ひらめきタイム、ハッピークッキン」という画面に切り替わったり、突然「クッキンQ（クイズ）」が挿入され、「チッチッチッチッチ、キラーン」とまいんが金田一一のようなポーズをとって正解を紹介するなどが、導入されている。

ミサンガ

声：小林晃子
CGで登場し、まいんへのアドバイスや料理のアイディアの説明を行う。金曜日には、まいんとのやり取りやその週のストーリーのおさらい、食の知識の紹介解説を行う。まいんの曲映像に参加したり、視聴者の投稿イラストに描かれたりもするが、その存在はD.J.ソルトやキャプテン シェイクには気付かれていない。まいんはD.J.ソルトには家で飼っている新しいペットと紹介していた。特集回では、料理開始のMCをソルトやシェイクに代わって務める。

キャプテン シェイク

演：星野卓也
第77話（2010年3月30日）から登場。テレビ番組『クッキンアイドル』の2010 - 2012年度の進行役を務める。しりとりと早口言葉が得意。好きな食べ物はラーメン。登場当初はぶっきらぼうな言葉遣いだったが、のちに丁寧な言葉遣いをするようになった。2009年度の進行役のD.J.ソルトとは違い料理を作ったりすることはないが、しばしばまいんが作った料理を試食する事はある。まいんの曲映像に参加はこれもD.J.ソルトとは違い通常回にはなく、特別番組・まいんのおせちでハッピー!での「ハッピーおせちでニューイヤー!」のみ。ちなみにライバル番組である「キッチンクィーン」や、やすのしん主演のヒーロー番組「宇宙ヒーローアンドロメダー」の大ファン。『クッキンアイドル アイ！マイ！まいん！みんなライバル！でもハピハピハッピー！編』の特典収録映像「まいんのクッキンスタジオ全部見せちゃいます」によると、シェイクが使うマイクに取り付けてある鶏は「シリトリ」という名前が付いているという。

過去の登場人物

ひな

演：辻口由奈
第154話（2011年3月31日）から1年間まいんと一緒に『クッキンアイドル』に出演。まいんと一緒に料理、歌とダンスを行うが、主には金曜日の「まいんとひなのはじめてクッキン」と、最後の「ハピハピハッピー」に出演した。初登場の翌日（2011年4月1日）の「クッキンフレンズ」に早くも似顔絵が送られていた。
2012年度は『ひなのお料理123』という新番組を持ったという設定になり、実写パートの登場が無くなった。

D.J.ソルト

演：テル
テレビ番組『クッキンアイドル』『まいんとD.J.ソルトのクッキンフレンズ』の2009年度の進行役を務めた。サングラスを掛けている。『クッキンアイドル』主にスタジオ内のDJブースに座り、「塩」と書かれたうちわを手にしたり、ブースごと左右に移動しターンテーブルで皿を回しながら、まいんのアイディアに驚きの声を上げたり、時間経過を報告したり、まいんの歌の紹介をしたりする。また、まいんの曲映像に参加する事もある。『〜クッキンフレンズ』では視聴者からの手紙の紹介を主に担当する。好きな食べ物は1番は唐揚げで、次にはお好み焼き。から揚げは、番組内でまいんに代わって作った事もある。また、酢飯作りやソーセージ作りを手伝った事もある。特集回ではしばしばまいんが作った料理を試食する事もある。
2010年3月26日放送分をもって降板。
なお、当初は「どーよテル」とクレジットされていたが、どーよの解散に伴い、2009年7月31日以降の新作分では「テル」のみの表記になっている。

その他の登場人物

おおばやし　

声：松山鷹志
特集7「まいんとキャプテン シェイクのクッキンフレンズスペシャル」（2010年7月26日放送）で、声の出演。まいん宛てに視聴者からの質問で「こまること」の回答にまいんが「おおばやしプロデューサーがメニューを急に変えること」と答え、字幕と顔入りで「ぼくはがっかり、トマトはしょんぼり」「おおばやし本気で怒ります！ムッカ〜」と怒り、一方まいんのおおばやしへの感謝の言葉に「今日もピカッと来てチョキッ！まいんちゃんカムカムおやゆびぃ〜」と反応する。

ドンブリン

声：古城望
特集8　まいんの大冒険スペシャル!宮城県のおいしいものでスペシャルどんぶり!!（2010年10月11日から10月15日）に登場。まいんが作ろうとしていた丼物の器のしゃべるどんぶり。おいしいものさがしに同行。

クリケット

声：佐久間レイ
特集9（2011年1月25日）に登場。実写パートではフライパンに変身した姿のみが登場し、妖精体は未登場。

辰年重兵衛

声：平野俊隆
「まいんのおせちでハッピー!」に登場したCGキャラクター。おせち料理の守り神。

おやきくん

声：古城望
特集14　まいんの大冒険スペシャル!冬のおいしいもの探し!!に登場（2012年1月）したCGキャラクター。現地に入りまいんが小祠でお参りした際に現れた。長野県の名物おやきをモチーフにした姿をしている。

クルック

声 : なし
まいんのハッピー・レシピ大賞 （2012年12月31日放送）に結果発表者として登場した白ハト。「クルック」としか発しないので、実際の発表はまいんが急遽行った。

• クッキンアイドルアイ！マイ！まいん フォトデコレーション（配信：NEC BIGLOBE、2011年7月20日配信）
• クッキンアイドルアイ！マイ！まいん めざまし＆クッキンタイマー（配信：NEC BIGLOBE、2011年8月5日配信）

• 『キッチンはマイステージ』（KICM-1289）
• 2009年度オープニングテーマ「キッチンはマイステージ」と、第1話のアニメパートで流れた「ヤムヤム☆キャベツアー」を収録。
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2009年9月30日
• 上記に加え、「キッチンはマイステージ」のまいんダンスバージョン（フルサイズ）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-41）も同日発売。通常盤・限定盤とも先着購入特典として「オリジナルステッカー」が付属。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。
• 『クッキンアイドル アイ!マイ!まいん! まいん歌のレシピ1』（KICA-1501）
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2009年11月26日
• 作中で歌われた歌を集めたベストアルバム。そのほか、オープニングテーマ「キッチンはマイステージ」を初め、番組BGMも多数収録。先着購入特典として中嶋敦子書き下ろし「まいんちゃんぬりえシート」を配布。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。
• 『クッキンアイドル アイ!マイ!まいん! まいん歌のレシピ2』（KICA-1502）
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2010年3月17日
• 先着購入特典として福原遥「まいんオリジナルポスターカレンダー」を配布。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。
• 『ミラクル☆メロディハーモニー』（KICM-1309）
• 2010年度オープニングテーマ「ミラクル☆メロディハーモニー」と、第76話・第77話のアニメパートで流れた「ストロベリーフェアリー」を収録。
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2010年6月9日
• 上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」のまいんダンスバージョン（フルサイズ）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-51）も同日発売。
• 『ハッピーレシピ』（KICM-3210）
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2010年7月21日
• スイートまいん&ラブリーみちか（福原遥・出野泉花）名義のキャラクターソング。
• 『クッキンアイドル アイ!マイ!まいん! まいん歌のレシピ3』（KICA-1503）
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2010年12月8日
• 上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」エレポップミックス（ショートバージョン）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-91）も同日発売。
• 『クッキンアイドル アイ!マイ!まいん! まいん歌のレシピ4』（KICA-1504）
• 発売元：キングレコード
• 発売日：2011年3月16日
• 上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」チアガールミックス（ショートバージョン）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-93）も同日発売。

2009年度オープニングテーマ「キッチンはマイステージ」と、第1話のアニメパートで流れた「ヤムヤム☆キャベツアー」を収録。
発売元：キングレコード
発売日：2009年9月30日
上記に加え、「キッチンはマイステージ」のまいんダンスバージョン（フルサイズ）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-41）も同日発売。通常盤・限定盤とも先着購入特典として「オリジナルステッカー」が付属。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。

発売元：キングレコード
発売日：2009年11月26日
作中で歌われた歌を集めたベストアルバム。そのほか、オープニングテーマ「キッチンはマイステージ」を初め、番組BGMも多数収録。先着購入特典として中嶋敦子書き下ろし「まいんちゃんぬりえシート」を配布。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。

発売元：キングレコード
発売日：2010年3月17日
先着購入特典として福原遥「まいんオリジナルポスターカレンダー」を配布。また、一部の店頭販売・通販でポストカード付属。

2010年度オープニングテーマ「ミラクル☆メロディハーモニー」と、第76話・第77話のアニメパートで流れた「ストロベリーフェアリー」を収録。
発売元：キングレコード
発売日：2010年6月9日
上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」のまいんダンスバージョン（フルサイズ）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-51）も同日発売。

発売元：キングレコード
発売日：2010年7月21日
スイートまいん&ラブリーみちか（福原遥・出野泉花）名義のキャラクターソング。

発売元：キングレコード
発売日：2010年12月8日
上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」エレポップミックス（ショートバージョン）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-91）も同日発売。

発売元：キングレコード
発売日：2011年3月16日
上記に加え、「ミラクル☆メロディハーモニー」チアガールミックス（ショートバージョン）の映像を収録したDVDが付属する期間限定生産盤（KIZM-93）も同日発売。

2009年度放送分とスペシャル版は、発売元：スーパー・ビジョン 販売元：フライングドッグ／ビクターエンタテインメント。2010年度放送分は発売・販売元：日本コロムビア。

• ニンテンドーDS用『クッキンアイドル アイ!マイ!まいん! ゲームでひらめき! キラメキ! クッキング』
• 発売元：コナミデジタルエンタテインメント
• 発売日：2010年2月25日
• 2010年11月25日には廉価版（ベストセレクション）が発売された。

発売元：コナミデジタルエンタテインメント
発売日：2010年2月25日
2010年11月25日には廉価版（ベストセレクション）が発売された。

• ハピハピメロディマイク（ジョイパレット、2012年）
• まいん!　ハートのドレッサー
• パンパン♪フライパンタンバリン（ジョイパレット、2012年、JANコード 4975201330125）
• 板パズル55ピース「B4パズル クッキンアイドル アイ！マイ！まいん！ 01」（ショウワノート)
• まいんといっしょ！アイドルコスチューム（ジョイパレット、2012年）
• きらめきスウィーツセット（ジョイパレット、2012年）
• 子供用安全包丁（ヤクセル）
• タイマーブレスウォッチ（ジョイパレット、2012年）
• まいんのおふろでケーキやさん（ウィズ、2010年）
• ハピハピカラオケスタンドマイク（ジョイパレット、2012年）
• エプロン風コスチューム（エイコー、2010年）