「競馬」をテーマにした動物漫画。第42回（平成8年度）小学館漫画賞児童部門受賞。

『週刊少年ジャンプ』（集英社）1994年50号から1997年18号にかけて第一部（有馬記念まで）が、同年24号から1998年9号にかけて第二部（海外遠征編）が連載された。なお、物語の終盤に連載が打ち切られたため、完結編が『赤マルジャンプ』1998年SPRINGに掲載された。話数カウントは「週刊○馬」。2009年2月時点で文庫版を含めた累計発行部数は900万部を記録している。下品なギャグ色が強い作品であるが、それとは裏腹にシリアスなドラマが展開され、正統派競馬作品として根強い人気がある。

本作は物語序盤では人間と動物（馬やネズミ）の関係は現実世界のそれと変わりないものであるが、序盤を過ぎてからは人間と動物たちが対等に台詞のやりとりをする世界になっていった。特に主人公の馬、マキバオーのパートナーとなる騎手の山本菅助（後述）が登場する頃からは、マキバオーたち競走馬やネズミのチュウ兵衛と人間たちが直接会話をしている場面が随所に見られる。

『週刊プレイボーイ』（集英社）2006年40号（10月16日発売号）には、マキバオーとベアナックルがディープインパクトを観戦する漫画「んあっ!!マキバオーの『凱旋門賞』観戦記なのねっ!」が掲載された。過去には、1996年のブリーダーズカップ・クラシック（シガー、タイキブリザードなどが出走）も「観戦」している。

『週刊プレイボーイ』2007年15号（3月26日発売号）から続編「たいようのマキバオー」が連載開始。

2014年4月、投票サイト・オッズパークのイメージキャラクターにマキバオーが就任、テレビCMも放送された。

この作品は「白い奇跡」と呼ばれた小さな競走馬「ミドリマキバオー（うんこたれ蔵）」の物語である。

北海道勇払郡鵡川町の「みどり牧場」にて、名馬ミドリコの血を引く待望の仔馬が誕生するが、生まれたのはとても馬とは思えない姿と性格をした間の抜けた白馬だった。走ることが嫌いで、名前も付けられずに育てられていた仔馬だったが、あるときミドリコが借金のカタに別の牧場へ連れ去られてしまったため、母親に会いたい一心でみどり牧場を脱走する。道中、とある森の中で後の親分肌となるネズミのチュウ兵衛と出会い「うんこたれ蔵」と名付けられた仔馬は、さまざまな困難を経て母親と再会を果たし、自らも競走馬の道に進むことを決意する。

チュウ兵衛とともに牧場に戻ったたれ蔵は、スパルタ調教師・飯富 昌虎や小柄な騎手・山本 菅助との特訓により自らの才能を開花させる。そしてカスケードらライバルとの出会い、競走などによって、競走馬「ミドリマキバオー」として成長していく。

1996年3月2日から1997年7月12日までフジテレビ系で全61話が放送された。制作はスタジオぴえろ。

ローカルセールス枠のため、一部の系列局は遅れネットまたは未放映であった。

2010年代にはCS放送局のキッズステーションや独立U局などで再放送され、2021年1月からはフルHD画質に修復されたデジタルリマスター版が競馬中継を主にしたグリーンチャンネルにて放送された。

アニメ版では競馬記者が若い美人記者であったり、飯富勝や本多麗、堀江ヒゲ治といった子供が登場したりと、原作と比較してよりファミリー向けになっている。また、日本ダービー以降は大幅にアニメオリジナルの演出が入り、有馬記念に勝利したあとはさらに上を目指すべくアメリカへ遠征するという、完全オリジナルストーリーで最終回を迎える。

原作と違って、フウリンカザンの転倒理由が単なる「事故」から「観客の新聞が飛んできて足に絡まったため」に変更、木曽と昌虎の仲たがいが解消する、ミドリコが途中でマキバオーの元へ戻ってくる、「チュウ兵衛が死亡しない」といった変更点がある。 チュウ兵衛が死亡しない点に関しては、当初アニメ版「みどりのマキバオー」は3クール・年内いっぱいの放送予定、つまりダービーが最後の戦いとなる予定であり、アニメ版はファミリー向けでありなおかつ最終回でキャラクターが死ぬと後味が悪くなるため、チュウ兵衛が死なないストーリーとなった。ところが半年分の放送延長が決定したため、チュウ兵衛をそのまま調教助手のような立場で出さざるをえなくなった事情がある。

当時同じくフジテレビが制作した『スーパー競馬』が協力に携わっており、アナウンサーの福井謙二、三宅正治、青嶋達也がF・MAPとしてオープニング主題歌を歌っており、また三宅や青島の他にスーパー競馬で実況経験のある塩原恒夫や後に競馬実況を担当する吉田伸男が競馬実況のアナウンサー役として出演しているのも見どころである。

映像ソフト化については、1998年にポニーキャニオンからVHS全15巻がリリースされたが、現在は、全巻廃盤となっている。また、2009年2月20日にバンダイビジュアルから『みどりのマキバオー DVDメモリアルボックス＜初回限定生産＞』が、さらに、2011年1月28日には、生誕15周年を記念して、同じくバンダイビジュアルから『みどりのマキバオー DVDメモリアルボックス (アンコールプレス版)』が発売された。

アニメ25周年を記念し、2022年7月27日にフルHDリマスターを収録したBlu-ray BOXが発売。東京都の渋谷モディ7階にて同年1月14日から30日まで、25周年を記念した展示などのイベントが開催された。また、映像特典として、原作最終話をアニメ化した新作「終わらない挑戦!!」を収録。新作では実況を楠田敏之が担当。

• ベアナックルの子分にニャンちゅうが登場する（文庫版にニャンちゅうの著作権に関する但し書きあり）。
• ミドリマキバオーの鼻の部分をサングラスに見立てると、タレントのタモリの顔のようになると、『笑っていいとも』で紹介されたこともある。
• 吉本新喜劇座長の吉田裕は、その表情から『マキバオー』といじられるギャグがある。
• コミックス裏表紙のJC（ジャンプ・コミックス）のロゴマークには、「ジャパンカップ」という手書き風の文字が書かれている。
• 本作は当時同時期にて連載されていた『幕張』でもギャグとして扱われ、作者つの丸も登場するが、パロディの域からの逸脱行為とも見做されかねない『幕張』の作者木多康昭の暴挙に対してつの丸はコメント欄で、「『幕張』には正直迷惑している。しかし怒ったら奴の思うツボなのも分かっている…」と苦言を呈した。しかし実際には現在も仲間として飲みに行くことがある。
• モーリアローを演じた山田雅人はのちに、2003年から2010年にかけて東海テレビ放送の『DREAM競馬』→『競馬beat』で司会を担当している。
• 「第63回 日本ダービー」が行われた週は作中の「第63回 日本ダービー」でミドリマキバオーがスタートから先頭に立ち、直線ではカスケードと並んでゴールし日本ダービーの翌日にGIで史上初の1着2頭同着となる話が連載された。作中のダービーでは1番人気カスケード（3番枠）2番人気ミドリマキバオー（12番枠）だが、実際に行われたレースでも1番人気ダンスインザダーク（3番枠、鞍上・武豊）2番人気ロイヤルタッチ（12番枠、鞍上・南井克巳）という偶然が産まれた。この年のダービーを勝ったのはフサイチコンコルド（鞍上・藤田伸二）。
• 少年誌で連載していたこともあり、専門用語等は作中で語られるか注釈で解説されていた。しかし、「皐月賞は牡馬だけのGIレース」（実際は牝馬も出走できる）、「父親が同じで兄弟関係」（実際は母親が同じで兄弟関係となり、父親が同じであっても母親が違うと兄弟関係ではない）など時折間違いも見られた。
• 劇中で使用されている｢ファンファーレII｣は、プロ野球選手の片岡篤史の応援歌のファンファーレ部分の原曲になっている。この曲は日本ハムファイターズ所属時の1999年に作られ、阪神タイガース移籍後も2003年まで使用されていた。阪神移籍後に、｢右投げ左打ち 実家は檜風呂｣などと、替え歌が作られた事でも知られている。