声 - 内山昂輝、日岡なつみ（幼少期）/ モーションアクター - カサハラケント
本作の主人公。私立聖昭学園の2年生。17歳。7年前の小学生時に誘拐されるが、ミロに助けられ、その際に彼女の残した「いつか訪れる危機において、あなたがみんなを守る」という言葉を信じて懸命に努力してきた。それゆえ正義感は強いが、ミロの言葉を盲目的に信じた結果、重度のメサイアコンプレックスに陥っており、他人の言葉に耳を貸さず、自分が少しでも蔑ろにされると周囲に当り散らすようになってしまっている。そのため、反省や謝罪といった行為も忌避し、反感や恨みを買いやすいことから、幼馴染たちや叔父、黒岩から幾度も注意や叱責をされている。
オペレーション・ネフィリム時は多少なりとも態度を緩和させるが、慶作を失ったことに衝撃を受ける。その後の黒岩の死やミロの跳躍が近いことを知り、混乱と絶望から投げやりになるも、ルウの叱咤とミロの言葉を聞いて立ち直る。これまでの態度も少なからず反省し、リヴィジョンズ本拠地への再侵攻では1人での突入を行うが、慶作と融合したニコラスと対峙。彼を追って時空の穴へ飛び込む。なお、アーヴは渋谷転移前では大介を単なるバックアップ要員と見ていた。
追った先では誘拐事件の現場に出たことで驚くが、子供時代の大介たちを引き連れてミロの所へ赴き、慶作の殺害を防ぐ。そして、そこに現れたニコラスと決着を付けるため、「俺の使命で運命だから」と用意されたパペットに乗り込んで時間の外の空間へ行き、死闘の末にゲシュペンストを撃破する。今まで慶作の意識が自身を守っていたことを知り、彼の消滅を見届けた後、空間に手を差し伸べたガイ、ルウ、愛鈴の3人によって元の時代へ帰還を果たした。全てが終わった後は、慶作がきっとどこかで生きていると考え、いつかミロや慶作と再会することを信じていた。

声 - 小松未可子
本作のヒロイン。未来の組織「アーヴ」に属する「バランサー」と呼ばれるエージェント。19歳。渋谷転移事件後、シビリアンの襲撃を受ける大介たち2017年の渋谷の人々に接触し、現状を説明して最終的に渋谷を過去へと戻すための協力関係を結ぶ。ミロ自身は彼らへの支援を惜しまないつもりだが、アーヴ上層部の思惑と揉める渋谷の人々の間に挟まれ、思うようにいかない現状に歯がゆさも感じている。
大介たちS.D.S.の5人は2010年に彼女と瓜二つの女性に出会いメッセージを受け取っているが、全員に向けて話したはずの言葉でありながら各自で異なる内容を認識しており、加えて2388年で出会った当初のミロは大介たちとの面識がない。後者については、時間跳躍でこの先過去に行くためではないかと推測する。跳躍命令時はムキューによる渋谷襲撃が重なったため、時間ギリギリまで囮役を買って出る。だが、跳ぶ前に上層部から伝えられたのは慶作の抹殺任務であった。
跳躍前にはリヴィジョン計画についてや、慶作が時空の特異点になることは予測不可能だったため、アーヴは渋谷の人間が失敗したと判断し、元の時代に戻さずこの時代に取り込むであろうとの伝言を残している。過去においては慶作を誘拐するも逡巡しており、その場に現れた大介に驚き、任務を放棄する。最後はニコラスとの戦いに赴く大介に姉がしてくれていたおまじないを行い、「2017年でまた会おう」と述べて送り出した。

「#堂嶋 大介」を参照。

声 - 島﨑信長、大地葉（幼少期）
大介の幼馴染の1人。私立聖昭学園の2年生。17歳。ルウの双子の兄。常日頃から痛い言動を繰り返す大介に強い憤りを感じており、度々彼を諌めている。過去のミロからは「全てを疑え」という言葉を送られており、それがきっかけなのか、慎重な行動が目立つ。大介との衝突が多かったものの、黒岩の死後はルウの叱咤もあり、互いの関係も改善した。パペット機能停止後はS.D.S.の存在価値がなくなったと一時的に自暴自棄となる。最終的には大介を時間の外側の空間から救うため、ルウと愛鈴の3人で力を合わせ、彼を自分たちの元へと引き寄せた。

声 - 高橋李依
大介の幼馴染の1人。私立聖昭学園の2年生。17歳。ガイの双子の妹。兄と同じく、大介の言動には辟易しており、度が過ぎるお節介焼きと見て呆れているが、兄ほど苛烈な態度は取らない。戦闘では兄との息の合った連携によって敵を相手取る。過去のミロからの言葉は他の4人と違ってほとんど覚えていない。第10話では自暴自棄になった大介とガイを殴って活を入れた。実は誘拐事件の際にミロではなく大介から「大介を信じろ、忘れないで」と言われており、その言葉がニコラスに騙されるガイと愛鈴を正気に戻す切っ掛けを作った。

声 - 石見舞菜香
大介の幼馴染の1人。私立聖昭学園の2年生。17歳。あだ名は「マリマリ」。大人しい性格で、唯一大介を理解している。幼い頃から現在に至るまで彼に好意を抱き続けている。戦闘は苦手で、シビリアンの正体を知ってからはストリング・パペットへの搭乗をより忌避するようになる。過去のミロからは「最後は自分で決めなさい」という言葉を送られている。仲間同士の関係をなによりも大事に思っているため、仲違いが起きる度に心を痛めていた。最終的にはガイやルウと共に時間の外側の空間から大介を助け出した。

声 - 斉藤壮馬、諏訪彩花（幼少期）
大介の幼馴染の1人。私立聖昭学園の2年生。17歳。衝突することが多い大介やガイたちを宥める仲介役。元々愛鈴に好意を抱いていたが、彼女は慶作の想いに気づいていない。第1次帰還計画実行時に母親をリヴィジョンズ側へ連れ去られてしまう。過去のミロからは「全てを受け入れなさい」という言葉を送られている。オペレーション・ネフィリム決行時において、母がニコラスによって目の前で殺されたことに激昂し、彼を追った先でチハルを倒すものの、虚無の結晶を残してその場で消失する。アーヴは渋谷転移前では慶作を最重要人物と見ていた。その後は時空の狭間に飛ばされてゲシュペンストと化すが、ニコラスに体を融合されてしまう。それでも辛うじて残っていた意識で大介を守っており、最後は大介を消そうとしたニコラスを止め、共に消滅していった。

声 - 櫻井孝宏
大介の叔父の外科医。大介を自分の家へと住まわせている。大介に対しては態度を諫める時もあるが、叔父として彼を心配している。第1次帰還計画実行時にリヴィジョンズ側へ連れ去られる。後に隙を見て一人で逃げ出し、無事に保護される。その後は黒岩たちに協力し、帰還後に対策を取るためRVウイルスのサンプルを確保したほか、ストリング・パペット再起動のために尽力する。

声 - 遠藤綾
私立聖昭学園の養護教諭。転移後のリヴィジョンズ襲撃の際、恐怖から大介たちを見捨てて逃げてしまった。結果、それが原因で一部の生徒から叱責される羽目になる。その後は自治会長の横山の下で働いて自治会の健康管理を担い、S.D.S.を取り込もうとしおらしい態度で大介に近づいたこともあった。ムキューによる渋谷襲撃時は身を挺して愛鈴を庇い、その後もS.D.S.を手助けする。

声 - てらそままさき
渋谷警察署の署長。私立聖昭学園の戦闘映像を見て大介やミロたちと接触、彼らや区長と協力体制を築く。渋谷を守るためにS.D.S.を結成し、リヴィジョンズに対抗できるストリング・パペットの戦力を見込む。ただし、増長する大介の暴走を警戒しており、ガイをS.D.S.のリーダーに任命して彼に手綱を握らせている。アーヴの助力は期待できないと判断し、ミロには相談せずに独断で大介たち5人にリヴィジョンズ本拠地への潜入任務を言い渡す。
オペレーション・ネフィリム後は、独断で行った作戦が失敗したことから突き上げを喰らい、牟田のシンパたちによるクーデターを招いてしまう。人質になったルウと香苗を救出すべく、S.D.S.と協力して牟田の下へ向かうが、最後は香苗を庇って牟田の銃弾を受け、その命を落とした。死の間際にはS.D.S.や香苗たちに遺言を残し、全員で元の時代に帰るよう告げた。

声 - 飛田展男
渋谷区の区長。現状を知り、ミロや黒岩と協力して渋谷臨時政府樹立を宣言、自らは総理を名乗る。本人曰く「リベラル」だが、自己保身と権力欲に塗れた俗物。チハルと会談した際に手渡された帰還者名簿に自分の名前があったことから、名簿に記載のない人々を裏切ると知りながら取引に応じ、政府としてのリヴィジョンズへの協力を一方的に宣言。ミロを拘束し、第1次帰還計画を実行してストリング・パペットをも引き渡そうとするが、黒岩に外患援助罪で逮捕される。
後に自身のシンパたちによるクーデターで牢屋から解放され、ルウと香苗を人質に取り、新たにリヴィジョンズとの交渉を進める。S.D.Sへは傲慢な態度で慶作の死を馬鹿にし、交渉にきたニコラスを遜って出迎えるが、黒岩たちの反逆とニコラスが大介の提案を蹴ったことで交渉は破綻。最後は自暴自棄に陥り、落ちていた銃を拾って香苗を撃とうとするも黒岩と相撃ちになり、自分の死を理解できないまま死亡した。

声 - 寺崎裕香
渋谷警察署の婦警。S.D.S.結成後、連絡係に任命される。いざという時には自ら囮になるなど、警察官としての誇りは高い。ミロからの進言で、S.D.S.の一員として戦闘中の指揮も執る。オペレーション・ネフィリム時にも同行し、救出された人質たちを渋谷へ連れ帰った。黒岩を尊敬していたため、彼の死後は混乱する職員を叱咤し、牟田の協力者についても嫌悪しつつも黒岩の「皆で帰る」という思いのため、割り切るよう努力していた。

声 - 宝亀克寿
渋谷転移後に発足した渋谷中心街自治会の代表。飲食店のオーナーでもある。当初は渋谷臨時政府やS.D.S.に非協力的で高圧的な態度を取っていたが、後に元の時代への帰還を目指して互いに協力するようになる。

声 - 千葉一伸
渋谷区の副区長。渋谷臨時政府の一員だが、牟田と比べると存在感は薄い。牟田や黒岩の死亡後はS.D.S.や自治会と協力し、元の時代への帰還を目指す。無事に帰還した後は、渋谷区長選に立候補した。

声 - 日笠陽子
リヴィジョンズのメンバー。ムキューの双子の妹。コミュニケーションボディは獣耳の生えた露出の多い女性姿。牟田と接触し、過去に帰還が可能だと伝え、第1次帰還計画実行の際に多数の市民を攫う。後に新しい肉体を生成し、ムキューが見守る中で意識を転移した直後、ニコラスに誘導されてその場に現れた慶作の手で殺害される。

声 - 田村ゆかり
リヴィジョンズのメンバー。チハルの双子の姉。一人称は「ボク」。コミュニケーションボディはゴスロリ服の少女姿。量子脳を使い、渋谷を2388年の時代へと固定している。姉妹同士の仲は良く、チハルと共にニコラスを下に見ており、S.D.S.のことも何も出来ないと高をくくっていたが、驕りと油断でチハルを失うこととなった。その後はリヴィジョンズのルーツ（祖先）に当たる帰還者リストの者たち以外の人間を無差別に捕獲することを渋谷へ通告。大量のシビリアンにより侵攻を行わせる。ニコラスの企みについては最後まで見抜けず、彼に量子脳を破壊された上に自身も始末される。

声 - 大塚芳忠
リヴィジョンズのメンバー。コミュニケーションボディは犬のようなぬいぐるみ姿。度々大介の前に姿を現し、彼を揺さぶる。イスルギ姉妹から見下されていることを察しており、オペレーション・ネフィリム時に慶作の母を殺害して彼を激昂させ、チハルの下へと導いて自ら手を下さずに彼女を葬った。ムキューへは自身がチハルの意思を引き継ぎ、2010年へ飛ぶことを告げる。大介から協力関係を結ぼうという提案に関しては、自らの存在が消える恐れがあることから却下した。
慶作消失後は彼が残した虚無の結晶を手に入れ、新しい肉体を構築。慶作とストリング・パペットを取り込み、本拠地に乗り込んできた大介の前に慶作の姿で現れる。虚無の結晶自体と融合した結果、超高次元存在へと進化を果たし、もはや不要になったリヴィジョンズの量子脳を破壊、ムキューも始末した上で過去へと跳躍する。過去に何度も大介を消そうとしていたが、いずれも失敗しており、今度こそ大介の存在を消すために彼を時間の外へ連れて行き、激闘を繰り広げる。その末に慶作の意識が大介を守っていたと気づいて彼を消そうとするも、慶作もニコラスの力を振るうことが可能という同一体の欠点が露呈し、最後は慶作に道連れにされて消滅した。

本作に登場する人型機動兵器。アーヴが開発した対リヴィジョンズ用の装備で、黒岩たちからの呼び名は「特殊強化戦闘装置」。計3機が存在する。インターフェイスはミロの姉がモデルとなっている。大介たち5人の若者しか操縦できない。搭乗者は「パペット・マスター」と呼ばれ、本領発揮には「ニューロスーツ」の着用が必須。白い機体は大介のみが使用し、黄色と赤の2機は他の4人が交代で乗り込んでいる。機体の大部分（AIや動力源以外）はシビリアン（リヴィジョンズ）の死体から作られており、損傷した場合は倒したシビリアンの部位を素材とし、それをナノレベルで分解・再構築して修復を行う。

ストリング・パペット（白）

近接戦闘用機で、武装は刀の「ERK（イーク、Explosive Recoil Katana）」や通常弾、誘導弾、散弾、バースト弾の4種類の撃ち分けが可能な専用ハンドガン。

ストリング・パペット（黄色）

中距離戦闘用機で、武装は2挺のアサルトライフル。オペレーション・ネフィリム時に破壊される。

ストリング・パペット（赤）

遠距離戦闘用機で、武装は大型スナイパーライフルと両肩部のミサイルポッド。

リヴィジョンズが使用する機械兵器。仮面のような不気味な顔と巨体が特徴で、後部に人間捕獲用のバイオケージを備える。動きは俊敏であり、鋭い爪によるパワーは脅威となる。元はRVウイルスに感染した「人間」の成れの果てであり、肥大化した四肢に機械の補強を行い、現在の姿となる。ウイルス汚染患者としては末期症状に当たり、知能は無いに等しい。

第6話で大介の前に出現した謎の個体。リヴィジョンズ側もその存在を把握しておらず、突然変異の高エネルギー体と分析されている。幽霊のように残像を残しながら移動し、大介に対し言葉で語りかけ、彼を動揺させた。第10話で再登場した際の言動で、大介はゲシュペンストが「慶作」ではないかと推測した。後にニコラスが慶作と融合したことでゲシュペンストの姿を取り、大介のパペットと激闘を繰り広げた。武装はクローによる斬撃と掌から放つハンドビーム。

2017年の渋谷が転送された、371年後の時代。渋谷の周囲には廃墟や荒野が広がっている。現在はアーヴとリヴィジョンズが戦いを繰り広げており、リヴィジョンズ側は渋谷をこの地に固定すべく策を巡らしている。RVウイルス（後述）はこの年代では死滅済。

2017年以降に世界的に流行したとされる致死率が高い感染症。一度発症すると四肢の末端が肥大化していき、体の異形化が進んで死に至る。人類社会が壊滅するほどの影響を与え、国家・産業・インフラが崩壊した。パンデミック当時に抗体を持つ人間と持たない人間が現れたことが、後のアーヴとリヴィジョンズが誕生した原因となった。

未来に転移後に結成された、大介たち5人が所属する渋谷防衛部隊。渋谷警察の下に置かれることとなる。第1次帰還計画実行時にリヴィジョンズの脅威が広く認識されてからは、渋谷の人々から応援されるようになるが、S.D.S.への反対派も存在する。

転移後の混乱を収めるために、区長の牟田誠一郎が立ち上げた臨時政府。総理大臣を自称する牟田（後に逮捕・失脚）や区役所の職員たち、黒岩ら警察官が所属し、S.D.S.も協力している。牟田と黒岩の死後は自治会とも手を結ぶ。

転移後に自治会長である横山信夫を代表として組織された団体。黒岩たち対策本部の上層部やS.D.S.には非協力的で、電力やストリング・パペットを独占する彼らへの批判を強めている。後に帰還のため、臨時政府やS.D.S.に協力する。

未来人の対リヴィジョンズ組織。名称は「Anti Historical ReVisonism」の略称。人的戦力は約10万人で、少ない人数ながら世界各地で活動している。「バランサー」のエージェントであるミロの所属先であり、カオス軌道への干渉を可能とする量子脳を持つ彼女らエージェントは、歴史の調整を担う。ミロ曰く、リヴィジョンズの手で既に1億を超えるアーヴの人間が犠牲になったとのこと。

未来人の組織。シビリアンを手駒として使う。所属メンバーはチハル、ムキュー、ニコラス。人類の破滅を食い止めるため、独自に「リヴィジョン計画」の遂行を企てる。RVウイルスに感染し、機械と融合（機械化）する道を選んだ者たちで構成され、肉体を持たない。生存のためにRVウイルスの抗体を持つアーヴの人間を襲い、正常な細胞を搾取している。他者との交渉時などには、コミュニケーションボディを使用する。

本作の舞台。東京都渋谷区の都市。突如2017年から2388年の未来へと転移する。転移後は渋谷臨時政府が立ち上げられる。稼働に制限はあるが、ストリング・パペットの電源ユニット（キューブ）を使えば転移後の街全ての電力をまかなえることが判明した。パペットの機能停止後は人力などで電力を集め、キューブへ充電を行う。

私立聖昭学園

大介たちが通う私立高校。未来への転移時に校舎の半分が消滅・崩壊する。

渋谷区役所仮庁舎

対策本部が置かれた。

渋谷警察署

区役所と協力している。

アーヴが開発した兵器。詳細は「ストリング・パペット」を参照。

ストリング・パペット搭乗時に着用する専用パイロットスーツ。機体との同調率を上昇させる。

リヴィジョンズが用意した交渉用の体。生体機能はなく、容姿は2017年前後の風俗を参考にしている。

リヴィジョンズに攫われた人質の救出と、彼らの持つ量子脳の破壊を目的としたリヴィジョンズ本拠地への潜入任務。ミロとS.D.S.の5人に香苗の計7名により行われた。最終的にはチハルを倒し、人質の一部を助け出すことに成功するも、量子脳を破壊することはできなかった上、慶作とストリング・パペット1機を失う結果となった。

リヴィジョンズが2388年時に実行しようとしていた計画。渋谷転送実験を試験台に、過去の世界の地域を未来へと移し、パンデミックの時代を跳躍して人類の衰退を阻止するというもの。アーヴはそれを人類救済の名を借りた材料（人間）の確保計画と推測したが、転送された人々がリヴィジョンズの姿を嫌悪してアーヴの味方に付くだろうという判断から、計画を利用するために阻止はされなかった。