東京近郊の短大に進学した優子は、学業の傍ら、ハイティーン向けのノベル雑誌で作家として『実体験モノの恋愛小説』を執筆していた。しかし、父親が作家活動に反対し続けたため、編集者の永山和弘が保証人となり、アパートを借りての一人暮らしとなった。

引越は、友達の高幡多可子と北野深雪が手伝い、作業が終った後の雑談で、二人は優子に長沼博士との“経験”について訊ねる。まだ処女でBより進んでいないことを打ち明ける。多可子は博士を「ガキ」、深雪は「不能」呼ばわりする。

その後、優子は一人でアパートの挨拶巡りに出かけると、他人の詮索をしてきたり、居留守を使い挨拶をしないなど独特の性格をもった住民に戸惑ってしまう。晩に博士が来訪して引越を手伝えなかったことを詫びる一方、優子は一晩泊まるか尋ねると、博士は冷たくあしらい帰宅してしまい、前途多難な新生活で嫌悪感に包まれる。

あくる日、キャンパスでは、クラスメイトが、優子の小説の相思相愛な展開に期待を寄せるが、エッチ未経験の優子は、口をつぐんでしまう。帰宅後、執筆作業をするにもアイディアが浮かばずにいる中、左の隣室の壁から喘ぎ声とベッドが軋む音が漏れる。優子は「取材」として聞き入ってしまい、博士を興奮させてその気にするべく呼び寄せようと電話をすると、大学のサークル合宿で八丈島に居ると言う。優子は、再度電話して一方的に博士を侮蔑しつつ非難するが一方的に切られてしまい、孤独な状況に陥る。

その翌日、右隣の住民から“うるさい”と苦情を寄せる手紙がドアポストに入れられる。詫びに行こうとベランダを伺うと、突然無言で水を全身に掛けられてしまい、ショックで風邪気味になり寝込んでしまう。その後、新聞販売員からの押し売り的な勧誘に困惑した所で、締め切りが迫っているとして来訪した永山が止めに入り、難を逃れる。ベッドに腰掛ける優子は、“経験”のことでトラウマになり、原稿が進んでいないと告白すると、永山は「彼とは別れて欲しい」と告げ、自分は優子に気があることを打ち明ける。キスを交わすと優子は脱力し、永山に抱き寄せられてしまう。そこで博士からの携帯電話の着信音が鳴り響く。優子は永山に詫び、「大人になった気でいる、甘ったれな子供だった」と泣いてしまい、永山はそんな優子を慰めて家を出る。

優子は博士に電話すると、合宿を早退して国内線で羽田空港へ降り立ち、優子の家に向かう所であった。優子の家に着くと、博士は作家稼業で自活している優子に対して、“自分は将来がわからず優子と過ごして行く自信が無かった”と告白して、二人は縒りを戻した。

優子と博士が縒りを戻した翌朝、下の階の住人から燃えないゴミにコンドームを捨てたことを指摘された優子は、顔を赤らめてその場を去って行った。

文庫版掲載にあたり、以下のネーム（絵柄・モノグラム）が加筆・修正されている。

• 表紙は掲載版（カラー）と文庫版（描き下ろし）で絵柄が異なるが、どちらも優子が自身の著者名の入った「水色時代」の本を手に触れている。

• 永山が優子にキスをした後のシーン

• 掲載版では裸での愛撫（前戯）となっているが、文庫版ではワイシャツ・ブラウスを着用しており、ハグのような状態となっている。
• 47ページの永山が優子の胸をペッティングするコマ（3カ所全て）が背景トーンに差し替えられている。
• 47ページ1コマ目のモノローグ「やさしくて なれた手つき」が「厚くて 熱い唇」に変更
• 47ページ3コマ目のモノローグ「リードしてくれる」が「リードしてくれて…」に変更
• 48ページ1コマ目冒頭のモノローグ「『計算高い女』だと自分でも思うけど…」と、文末の「永山さんのほうが “きっと…”」の語句が削除
• 48ページ目3コマ目のモノローグ「着メロは“博士くん…！”」語句が削除

• 掲載版では裸での愛撫（前戯）となっているが、文庫版ではワイシャツ・ブラウスを着用しており、ハグのような状態となっている。
• 47ページの永山が優子の胸をペッティングするコマ（3カ所全て）が背景トーンに差し替えられている。
• 47ページ1コマ目のモノローグ「やさしくて なれた手つき」が「厚くて 熱い唇」に変更
• 47ページ3コマ目のモノローグ「リードしてくれる」が「リードしてくれて…」に変更
• 48ページ1コマ目冒頭のモノローグ「『計算高い女』だと自分でも思うけど…」と、文末の「永山さんのほうが “きっと…”」の語句が削除
• 48ページ目3コマ目のモノローグ「着メロは“博士くん…！”」語句が削除

• 永山に慰められ、帰宅するシーン

• 52ページ目1コマ目のモノローグ「現実は 本当に大事なものがなんなのかも見極められない」が「本当は まだ誰かがそばにいないと不安でしょうがない」に変更
• 53ページ2コマ目のモノローグ「あの告白も きっとその場限りのウソ」が「そう 永山さんの優しさはビジネス」等へ変更

• 52ページ目1コマ目のモノローグ「現実は 本当に大事なものがなんなのかも見極められない」が「本当は まだ誰かがそばにいないと不安でしょうがない」に変更
• 53ページ2コマ目のモノローグ「あの告白も きっとその場限りのウソ」が「そう 永山さんの優しさはビジネス」等へ変更

• 博士と分かち合うシーン
• 掲載版ではベッド上で裸（上半身のみ描写）の博士が、強く目を瞑りながら優子を正常位で抱く（博士がイクとき）コマが、文庫版ではベッド上で重ねながら握り合う二人の片手の絵柄に変更されている。

• 掲載版ではベッド上で裸（上半身のみ描写）の博士が、強く目を瞑りながら優子を正常位で抱く（博士がイクとき）コマが、文庫版ではベッド上で重ねながら握り合う二人の片手の絵柄に変更されている。

• 『水色時代』 - ちゃおフラワーコミックス （1991年-1994年） 全7巻
• 1巻に『午前零時奇談』、4巻にやぶうちのデビュー作である『ボインでごめん!』、6巻に『純情powerのトップ!』がそれぞれ収録されている。
• 『新水色時代』 - ちゃおフラワーコミックス （1996年-1997年） 全3巻
• 『水色時代 -12歳の季節-』も収録。
• 『水色時代』 - フラワーコミックス・デラックス （2000年） 全4巻
• 『水色時代』 - 小学館文庫コミック版 （2009年） 全5巻
• ちゃおフラワーコミックス版（1-3巻）、『―12歳の季節』・『水色時代を過ぎても（文庫本版）』（4巻）、番外編（4-5巻）をそれぞれ収録。
• 『水色時代 ベストセレクション SHI・SHUN・KI』 - ちゃおコミックス （2019年8月30日発売、ISBN 978-4-09-870621-1）
• 『小学生編』・『―12歳の季節』・『中学生編』より思春期を題材にしたエピソードをピックアップして収録。
• 『水色時代 ベストセレクション MI・JU・KU』 - ちゃおコミックス （2019年10月1日発売、ISBN 978-4-09-870698-3）
• 『小学生編』・『中学生編』より学校行事を題材にしたエピソードをピックアップして収録。
• 『水色時代 ベストセレクション MU・JYA・KI』 - ちゃおコミックス （2021年4月28日発売、ISBN 978-4-09-871360-8）
• 高幡多可子・北野深雪をそれぞれメインにしたエピソードをピックアップして収録。

• 1巻に『午前零時奇談』、4巻にやぶうちのデビュー作である『ボインでごめん!』、6巻に『純情powerのトップ!』がそれぞれ収録されている。

• 『水色時代 -12歳の季節-』も収録。

• ちゃおフラワーコミックス版（1-3巻）、『―12歳の季節』・『水色時代を過ぎても（文庫本版）』（4巻）、番外編（4-5巻）をそれぞれ収録。

• 『小学生編』・『―12歳の季節』・『中学生編』より思春期を題材にしたエピソードをピックアップして収録。

• 『小学生編』・『中学生編』より学校行事を題材にしたエピソードをピックアップして収録。

• 高幡多可子・北野深雪をそれぞれメインにしたエピソードをピックアップして収録。

すべて小学館より発刊。

オリジナル版であるちゃおフラワーコミックス版は『水色時代』・『新水色時代』とも絶版になっているが、コミックパークにてオンデマンド出版で1997年増刷版が受注販売されている。また、ちゃおフラワーコミックス版を元にして電子書籍化もされ、各電子書店にて販売されている。

• 水色時代 複製原画集
• やぶうち優CD-ROM画集
• ポプコムソフトの一つとして発売。『水色時代』・『新水色時代』・『水色時代 -12歳の季節-』のイラストの他にやぶうちの連載作品の一つである『KAREN』のイラストも収録。

• ポプコムソフトの一つとして発売。『水色時代』・『新水色時代』・『水色時代 -12歳の季節-』のイラストの他にやぶうちの連載作品の一つである『KAREN』のイラストも収録。

• 原作：やぶうち優
• 監督：ときたひろこ
• シリーズ構成：武上純希
• キャラクターデザイン：山岡信一
• 総作画監督：一川孝久
• 色彩設定：酒井美晴
• 美術監督：金村勝義
• 背景：スタジオじゃっく、ART MAX
• 撮影監督：森下成一
• 撮影：スタジオトゥインクル
• 編集：岡安肇（岡安プロモーション）
• タイトル：マキ・プロ
• メインタイトルカラーリング：三沢伸
• 音楽：斉藤ネコ、山本はるきち
• 録音演出：田中一也
• 音響監督：三ツ矢雄二
• 効果：神保大介
• キャスティング協力：松田誠（ネルケプランニング）
• 音響製作協力：ビーライン
• 録音スタジオ：代々木アニメーション学院原宿スタジオ
• 現像：東京現像所
• 製作デスク：中島淳
• 文芸設定：大金正一
• アシスタントデザイナー：西崎亜維
• 広報：神宮綾→佐伯真美（テレビ東京）
• プロデューサー補：村瀬由美（テレビ東京）
• アソシエイトプロデューサー：茂垣弘道（スタジオコメット）
• プロデューサー：岩田圭介（テレビ東京）、杉山豊（NAS）
• アニメーション制作：スタジオコメット
• 製作：テレビ東京、NAS

• ほぼ同時期に『なかよし』（講談社）で連載され、1995年にNHK衛星第2テレビジョンでアニメ化された『あずきちゃん』とは、内容が似通っているということで、比較する読者やアニメファンが存在した。
• 次回予告のナレーターは、本編に関しては鈴木真仁が務めたが、樋口智恵子や宮島依里が務めたことがあった。そのため、第39話（もともとは最終話として製作された）の予告では、鈴木が予告を読み上げていたところに、樋口が「優ちゃんの恥ずかしいポエム満載の総集編」とちゃちゃを入れたため、鈴木が「じゃあその恥ずかしい予告を2回も読んだのはどこの誰よ?」と、楽屋オチ的突っ込みを入れている。また、思い出アルバム編では、その時々のメイン格のキャラクターを務める声優が、次回予告のナレーターを務めた。
• 小学館にとっては、『ちゃお』からのアニメ化作品中では唯一、幼児や小学校低学年の需要を全く考慮しなかった作品である。そのため、『幼稚園』や『小学一年生』『小学二年生』『小学三年生』などには掲載されず、放送期間の間、『幼稚園』と『小学一年生』では『魔法使いサリー（1989年版）』が再連載された。しかしスポンサーの関係で、幼児・小学校低学年向けの商品が発売されていた。

• 幼児・小学校低学年からの需要も多少は見込んでいたため、玩具なども発売されている。スポンサーのひとつだったタカラから主人公の人形（玩具扱い）など、セイカノートから「ぬりえ」や「きせかえ」、パズルが発売された。玩具メーカーのスポンサーは、タカラの他にハズブロージャパンが付いていたが、日本法人独自での新規玩具開発は行っていなかったため、関連商品の展開は行われなかった。
• 放送直後は、VHS・LDなどの映像商品が一切発売されず、2002年にパイオニアLDCから発売されたDVD-BOXが、初の映像商品であった。また、小学館の雑誌に原作が掲載された作品であるにも拘らず、小学館が発売元としては関与しなかったため、「小学館ビデオ」のクレジットが入っていない。

1996年12月20日から1997年1月5日まで博品館劇場、1月11日から15日まで梅田芸術劇場シアター・ドラマシティを会場に公演された。演出は三ツ矢雄二、台本は武上純希、音楽は佐橋俊彦が担当。キャストはアニメで担当した声優がほとんど続投だったが、当時ジャニーズJr.だった佐野瑞樹・榎本雄太が出演している。#登場人物を参照。

• オリジナルイメージアルバム 水色時代（ポニーキャニオン・1993年5月21日）

• CDシングル「水色時代」（日本コロムビア・1996年5月21日）
• CDシングル「約束はAlright!」（日本コロムビア・1996年10月19日）
• 水色時代 キャラクター・ソング・コレクション Present（日本コロムビア・1996年7月20日）
• ミュージカル水色時代（日本コロムビア・1996年12月21日）
• 水色時代 メモリアル・ミュージック・コレクション（日本コロムビア・1997年8月21日）
• コロちゃんパック「水色時代」（日本コロムビア・1996年8月21日）