『少年サンデー』連載版のストーリーは、1964年の連載開始当初は藤本と安孫子の両方で担当していたが、やがて藤本のみで担当するようになった。それ以外の雜誌に掲載された作品では基本的に藤本が担当。

1964年の連載開始から1976年の最後の読切まで、藤本と安孫子で作画を担当した（藤本は「Q太郎」らオバケ、安孫子は「正太」「伸一」「小池さん」を担当）。1985年の3度目のアニメ化の際のキャラクター設定書も、正太と伸一のものは安孫子が執筆している。

1964年から1967年の『少年サンデー』版他、一部の漫画作品は「藤子不二雄とスタジオゼロ」名義で連載され、スタジオゼロの面々が脇役や背景の作画を行った。特に石森章太郎は多数の脇役の作画を担当した。

学年誌連載版は主に藤子不二雄のみ（藤本と安孫子）で作画を担当した（背景等はアシスタントが作画）。

『よいこ』『幼稚園』版は、藤本が全ての作画を担当した（背景等はアシスタントが作画）。

1988年の独立後は『オバケのQ太郎』は合作、『新オバケのQ太郎』は「藤子・F・不二雄」名義となっているが、権利上名義が分けられたのみで、『新オバケのQ太郎』も1976年の最後の読切まで安孫子が一部の作画を担当している合作である。藤子プロのWebサイトの年表等には1971年の箇所に「『新オバケのQ太郎』は藤本弘の著作物」と記されていることがあるが誤り。正確には「『新オバケのQ太郎』は藤本弘と安孫子素雄の合作で、1987年までは藤子不二雄名義の著作物。その後権利を分割したため、1989年以降は藤子・F・不二雄名義の著作物」となる。

1987年の独立時に「合作はオバQあたりまで」と藤子が語ったことで、「最後の合作は1964年に描かれたオバQ」と誤解されがちだが、その後も多くの合作作品が発表されている。最後の合作となったのはドラえもんアニメ化後の1976年に描かれた『オバケのQ太郎』の読切作品（『月刊少年ジャンプ』掲載）。1964年から1976年までの『オバケのQ太郎』を年代順に読むと、両人の絵のタッチの違いが明確になっていく様を確認できる。

『週刊少年サンデー』編集部に出入りしていた子供の持ち込んだ自筆のお化け漫画｢ケバ男くん｣を見た編集者はお化け漫画を連載することを提案し、藤本が怪談やオバケ好きと聞いてオバケを主人公にした漫画を依頼した。

藤本と安孫子は当時作ったアニメスタジオ「スタジオゼロ」へ小田急線で通勤中に小田急→オバQ→「オバケのQ太郎」というタイトルを思いついた。以上は藤本が描いたマンガ『スタジオ・ボロ物語』やTBSにて2008年4月12日放送の番組『ブロードキャスター』における藤子Ⓐのインタビュー発言によるものだが、タイトルの由来については、これとは異なる説明もある。それは藤本と安孫子が共同で執筆した自伝『二人で少年漫画ばかり描いてきた』によるもので、まず最初に『オバケの○太郎』というタイトルが決まり、○の部分にはめる言葉を探していたとき、小説家の安部公房の本をパラパラとめくっていたら、Qという文字が目に止まり、愛敬のある文字だという理由でQ太郎になったというものである。『アサヒ芸能』2002年9月5日号の藤子Ⓐへのインタビュー記事などでも同様のことが本人から語られていたことがある。一方で幸森軍也著・鈴木伸一監修『ゼロの肖像 「トキワ荘」から生まれたアニメ会社の物語』（講談社、2012年）では、藤子Ⓐの説明にも触れつつ、○の部分を決めたきっかけとして「書店で藤本が見かけた魯迅の『阿Q正伝』」が紹介されている(また、同作の主人公「阿Q」という名称は日本語の感覚では、「Qちゃん」のようなイメージとなる(当該項目参照))。

連載1回目の「忍者ごっこ」のストーリーは、ゼロの事務所のそばで、忍者ごっこをしている子供達を見てそのまま決めた。

無事タイトルも決まり、スタジオゼロの財務を支えるスタジオゼロ雑誌部の仕事として、スタジオ所属のメンバーが手伝い、『週刊少年サンデー』誌上で1964年にスタートした（1964年6号からスタート。同号発売が1月22日、誌面クレジットの発行日は2月2日）が、読者の反応がまったくなく、連載は9回でいったん終了した。連載中は藤子もスタジオゼロを救うための仕事としてあまり力が入らず、周囲の期待もなかったというが、連載終了後読者から再開を求める手紙が殺到し、3か月後に連載が復活。再開後、藤本が基本的にストーリーを担当するようになった。

『少年サンデー』に「藤子不二雄とスタジオゼロ」名義で発表された作品で石森章太郎が多数の脇役の作画を担当したことは前述したが、つのだじろうや長谷邦夫もその他の人物を描いていた。北見けんいちは背景を担当していた。『オバケのQ太郎』の漫画の中で石森や赤塚の作品のキャラクター（『おそ松くん』の六つ子やチビ太など）が度々登場していたのはこのためである。

翌1965年になって、連載は小学館の他の雑誌にも広がり、さらにアニメ化もされ、「オバQブーム」と呼ばれる社会的現象にまでなった。それまではシリアス志向の強い作品の描き手としての印象も強かった藤子は、これを機に「ギャグの藤子不二雄」として社会的に認知されるようになった。

『鉄腕アトム』以来、それまで主流だったSFヒーローものが飽きられて視聴率が低下した中で、日本初のギャグアニメ『オバケのQ太郎』は登場。TBS系「不二家の時間」枠（日曜19時30分 - 20時）で放送された。初回から視聴率30%以上の人気を得て、アニメ主題歌の『オバケのQ太郎』はミリオンセラーを記録し、1966年第8回日本レコード大賞童謡賞を受賞。また声優の曽我町子が歌う『オバQ音頭』はレコード200万枚、スポンサーの不二家が行ったプレミアムキャンペーンでソノシート400万枚の大ヒットとなり、レコードはジャケットと価格に若干の変更がなされつつ、1980年代まで同一の規格番号(SCS-4)で生産され続けるというロングラン商品となった（初期盤のジャケットに掲載されていた2ページのカラー漫画が、後期盤では削除されている）。そしてアニメソングにおける音頭曲の先駆けとなり、現在でも子供向け音頭曲の定番のひとつとして親しまれている。1973年に発売されたコンパクト盤「実用ベスト4シリーズ・4大音頭」では、「東京音頭」「炭坑節」「相馬盆踊り」とともに「オバQ音頭」が収録されている。

本作の商品化業務は、放映局であるTBSから「オアシのないものがオアシ（銭）を稼ぐはずがない」と否定的な見解が下されてしまい、この推測は関係各社でも同様の判断が下されるなど放映当初は商品化する会社がほとんどいなかったため、原作を掲載していた小学館が行うことになった。ところが放映開始から半年ほどで人気が爆発し、巨額の商品化収入がそのまま小学館への収入へと繋がり、1967年に建築された小学館の本社ビルはオバQビルの異名を取るほど小学館を潤した。またこの小学館ビルが2013年に解体を控えた際、壁に漫画家たちが落書きをしたイベントでは、本来Q太郎の作画を担当した藤本（既に他界）に代わって安孫子（藤子Ⓐ）がQ太郎のイラストを書きサインを添えていた。

本作で培った小学館のキャラクタービジネスのノウハウは、後年の『ドラえもん』、『名探偵コナン』、『ポケットモンスターシリーズ』などでも生かされている。

その一方、子供たちの間で流行した「オバQごっこ」（白いビニール袋を被って遊ぶ）により女児が窒息死するという事故が起きている。当時の関係者らはこの遊びに関して注意を呼びかけた。

1966年末に『週刊少年サンデー』の連載は終了し、1967年3月にはテレビアニメも日曜夜の時間から転出することになった。円谷プロダクション制作の『ウルトラQ』『ウルトラマン』と共に爆発的な人気番組となり（TBSの日曜夜7時台は、他局から「恐怖のQQタイム」と呼ばれていた）、時間帯変更の時点で依然30%を超える視聴率を誇っていたものの、スポンサーの不二家から「オバQ商品の売れ行きはピークに達した。これ以上の売上は見込めないので、新しいキャラクター（の番組）にしてくれ」という強い要望が出たためである。後番組は、原作者・制作会社ともに同じ『パーマン』となった。テレビアニメは水曜18時の時間帯に移動したが、3ヶ月で新作の放映は終了し、以後は翌年3月まで再放映を流していた。この再放送期間中は学年誌では松山しげる・しのだひでお・西村英雄氏などによるコミカライズ版が藤子本人が描く『パーマン』と同時掲載で続けられた。

1969年、『「オバケのQ太郎」あれから四年…』と題して『ビッグコミック』に後日談のエピソードが掲載された（後述）。

前作の連載終了後も、「もう一度Qちゃんを見たい」という読者の要望が多く寄せられていた。その声に応える形で、小学館の学習雑誌にて新キャラクターのO次郎が登場する『新オバケのQ太郎（雑誌掲載時は『オバケのQ太郎』）』の連載が1971年から1973年まで続けられた。このときアニメ『新オバケのQ太郎』も1971年9月から1972年12月まで放送された。

1973年、『ビッグコミック』誌上で、15年振りに人間界にやって来たQ太郎と、大人になった正太のすれ違いと別れの様を描いた異色作『「劇画」オバQ』が掲載された。その後1976年、『月刊少年ジャンプ』に読み切り作品が掲載された。藤子本人が手がけた『オバQ』は事実上これが最後の作品となった。

1977年、『コロコロコミック』が創刊。他の藤子作品とともに『オバケのQ太郎』も掲載される。ただし、新作は描かれず過去の作品の再収録のみだった。1979年には藤本がネームを担当し、しのだひでおの作画による番外編『ドラQパーマン』も描かれ、翌年には『ドラえもん』の特番でアニメ化される。

1980年に『ドラえもん』以来の藤子アニメブームに乗り、前作までの製作を担当してきた東京ムービー新社により『がんばれ!!タブチくん!!』で実績のあったマルチラウンド方式による長編映画の企画が持ち上がるも藤子から難色を示された上映像化権がシンエイ動画に移った事により頓挫している。

1985年からシンエイ動画にて3度目のアニメ化がなされる。この際に新作連載の依頼が作者の下に来たが、「もうオバQのようなタイプのギャグ漫画を描くのは難しい」と、この申し出を断っている。結局、作者が示した新設定のキャラクターイラストの描き下ろしと、単行本（てんとう虫コミックスの傑作選全6巻と『新オバケのQ太郎』全4巻）のカバーをリニューアルして、漫画連載は『コロコロコミック』（『コロコロ』での創刊時からの再掲載は終了していたが、再び復活する形で）や学習雑誌に風太郎、しのだひでおのコミカライズ、もしくは過去の作品を再掲載する形が採られた。

• 週刊少年サンデー：1964年6号 - 14号、1964年24号 - 1966年51号
• 別冊少年サンデー：1964年秋季号・12月号、1965年1月号
• 少年サンデー増刊：1965年正月号 - 1967年正月号
• よいこ：1965年1月号 - 1967年6月号、1971年4月号 - 1973年4月号
• 幼稚園：1965年1月号 - 1967年3月号、1971年4月号 - 1973年2月号
• 小学館の学習雑誌
• 小学一年生：1965年1月号 - 1967年2月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学二年生：1965年1月号 - 1967年2月号、1971年4月号 - 1973年2月号
• 小学三年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年2月号
• 小学四年生：1965年1月号 - 1966年11月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学五年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学六年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年3月号・6月号
• 小学館コミックス：1965年夏季号 - 1966年春季号
• マドモアゼル：1965年12月号 - 1966年10月号
• 女学生の友：1966年1月号 - 12月号（番外編『オバケのP子日記』）
• ボーイズライフ：1966年3月号
• ビッグコミック：1969年3月号（『「オバケのQ太郎」あれから四年…』）、1973年2月25日号（『劇画・オバQ』）
• めばえ：1971年4月号 - 1974年3月号
• ベビーブック：1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学館ブック：1966年7月号（創刊号） - 1967年2月号
• 月刊少年ジャンプ：1976年5月号

• 小学一年生：1965年1月号 - 1967年2月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学二年生：1965年1月号 - 1967年2月号、1971年4月号 - 1973年2月号
• 小学三年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年2月号
• 小学四年生：1965年1月号 - 1966年11月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学五年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年3月号
• 小学六年生：1965年1月号 - 1966年10月号、1971年4月号 - 1973年3月号・6月号

本作は藤子不二雄の2人のほかに、石森章太郎やスタジオゼロが関わっている。藤子不二雄がそれぞれ独立し、さらに石森、スタジオゼロが関わっているため、四者の間で著作権料の割合で揉めていたのではないかという説。

両者にアシスタントとして携わったえびはら武司は自伝的自著『まいっちんぐマンガ道』の中でこれに近い説明をしている。前述の通り本作は藤子不二雄の事実上最後の合作であり、独立後に代理人を立てての法的な話し合いが始まった。また石ノ森らとの話し合いのほか、紛失原稿が多すぎること、そして後述の差別表現などの描き直しが膨大であること、これら全てをクリアーするためのハードルが多く、再版まで時間がかかってしまったとした。

ただし、台湾や香港では1997年頃までは公式に単行本が発売されており、アニメ（3作目）は、絶版中も独立前の「藤子不二雄」とクレジットが入った上でCSなどで再放送されていたり、石森が参加しているのは『少年サンデー』版のみで、それ以外の雑誌でのよっちゃん、ゴジラは藤本が描いているため漫画の単行本が出ない理由とするにはこの説は弱い。また、石森・安孫子・藤本による合作（風田朗とスタジオゼロ名義。鈴木伸一とつのだじろうも関与していた）の『レインボー戦隊』は、現在石ノ森のプロダクションである石森プロに権利があるが、「石ノ森章太郎萬画全集」でいち早く復刊された。

安藤は『新潮45』（新潮社）2004年11月号でこの問題を取り上げ、追加取材を行なって『封印作品の謎2』として2006年に出版。それによると、スタジオゼロから独立前の藤子不二雄と藤子スタジオへ著作権は戻され、石森プロも「『オバケのQ太郎』の著作権に関して主張したことはない」として、石ノ森やスタジオゼロとの著作権問題という説は否定されている。小学館では「作者サイドが表に出さないことにしている」と主張。原作者サイドの藤子スタジオは「藤子プロに任せている」、藤子プロは「権利問題ではなく作者の意志を守りファンを優先に活動している」、「遺された作品が膨大なので今はたまたま出していないだけ」という見解であった。

藤本の遺族（藤本夫人は藤子プロの現会長でもある）は、当時と現在の価値観の違い（差別描写説参照）から、故人の作品が表に出ることを警戒している（漫画コラムニストの夏目房之介も同様の見解をしている）。藤本本人が他界してから『藤子・F・不二雄大全集』が出版されるまでの間は、短編集や一部の児童向け作品が出版されたのみであった。また、全集『藤子不二雄ランド』も、Fの没後はⒶの作品だけを集めた『藤子不二雄Ⓐランド』として復刊され、Fの作品は復刊が見送られた。

また他にも、藤子両人は独立後も仲が良かったものの、Fの遺族とⒶ（2022年没）の親族が実は不仲であり、権利の取り分で揉めていたという説もある。安藤も『封印作品の謎2』において「藤子両人の周囲で起きている感情の問題が、封印の理由の一つではないか」と指摘している。

1980年代半ばより始まった差別表現への抗議やそれに対しての自主規制が原因だとする説。黒人差別が原因だとする説と差別用語が原因とする説、またはその両方が原因だという説もある。

1980年代に「黒人差別をなくす会」という団体が黒人の描写について差別的だと多くの出版社に抗議をした際、本作もその対象となり、てんとう虫コミックスと藤子不二雄ランドのうち「国際オバケ連合」の話を含む巻が回収された。これは、該当話に登場する「バケ食いオバケ」が人食い人種を思わせると抗議を受けたためである。そしてこれ以降、『オバケのQ太郎』の増刷は全面的に停止した。

同様にして一時絶版になった藤子作品に『ジャングル黒べえ』がある。きっかけとしてはこの「黒人差別をなくす会」による抗議が原因と言われているが、『封印作品の謎2』によると、この時回収されたのは「国際オバケ連合」が収録された巻のみで、作品全てを封印する理由には繋がらないとしている。なお、後に「国際オバケ連合」は藤子・F・不二雄大全集第4巻およびてんとう虫コミックス（新装版）第9巻に収録されているが、「人食い人種」というセリフについては別の表現に差し替えられている。

また、本作の初出時の版では「きちがい」「こじき」など、現在では放送禁止用語とされる語が多く使われている。これらについて出版社の圧力は避けたいということなかれ主義で出版を止めているという説もある。だが、同様の表現がされている作品としては『パーマン』や初期の『ドラえもん』などもあるものの、それらについては単行本の重版から該当する話を削除したり、セリフや表現を修正している（これは藤子・F・不二雄大全集においても例外ではない）ため、作品の全面封印の理由としては根拠が薄い。

以上のように、封印理由としては「FとⒶの間で起きた権利問題」と、「その周囲の人々で起きている問題」で出版が見送られていたとの説が最も有力である。

2007年、安藤の『封印作品の謎2』が『封印作品の闇』と改題の上文庫化された際、小学館の元幹部への追加取材がなされた。それによると、Ⓐの側は再版の許諾を早くから出していたが、F夫人が「FとⒶが共同で著作権を持つ作品を出したくない」との意向を持っていたためそれを拒否していた、と安藤は結論づけている。

2009年7月、『藤子・F・不二雄大全集』においてFとⒶの共著扱い（コンビとしての『藤子不二雄』統一名義ではなく、FとⒶ、両者の名前が記載されている）という形で、再び出版がなされた。

2015年7月からは、藤子・F・不二雄大全集における原稿スキャン版を元に、てんとう虫コミックスでも「オバケのQ太郎」新装版の刊行が行われ（藤子・F・不二雄、藤子不二雄Ⓐ名義）、2016年4月28日発売の12巻を以て刊行が終了した。なお12巻の限定版には、「別冊少年サンデー」1967年1月号の付録「サンデーゲーム盤」を49年振りに復刻。同ゲーム盤には「ラッキーレース」と、赤塚不二夫作成の「おそ松くん買い物ゲーム」、そしてオバQ・ドロンパ・P子が世界一周する双六「Qちゃんすごろく」が掲載されている。

さらに2018年4月から7月にかけて、てんとう虫コミックス「新オバケのQ太郎」新装版全4巻も刊行された。

• オバケは基本的に全員藤本が作画。ただし「なくなQちゃん」に登場するQ太郎のパパ（偽者）は安孫子作画。
• 名前のアルファベットは特殊な読み方をしないが、ここではカナ表記の読み仮名を記す。

本作のオバケは、普通連想するいわゆる「幽霊」「霊魂」「妖怪」といった類の存在ではなく、れっきとした一個の生物である。空を飛び（Q太郎の場合は最高時速40km、一度に50kmまで飛べる）、姿を消し、壁を抜け、力も割と強く、口の中に何でも放り込め（大量に放りこむと壁をすり抜けられなくなる）、動物と会話ができる、変身する（これは学習しないとうまくできない）といった特殊能力を持っている。人間と同じ食物を摂取できるほか、雲を食べる（人間である正太もオバケの国で雲を御馳走されたが、栄養になっているかは不明）。

かつては人間と地上で共存していたが、人間が進歩するにつれ、のんびり屋で嘘をついたり人を傷付けたりできないオバケは追い詰められて行った。化けて人間を脅かしたこともあったが（人間界に伝わる多種の妖怪はこれが元になる）、やがて雲の上にオバケの国を築いて隠れ住むようになった。

Q太郎（キューたろう）　※藤本作画（オバケは基本的に全員藤本）

声 - 曽我町子（1作目）、堀絢子（2作目）、天地総子（3作目）、鈴木みえ（現：一龍斎貞友、ドラえもん のび太のドラビアンナイト）
通称：Qちゃん。竹藪で生まれた（実際はQ太郎のタマゴだけ竹藪に落っことしたらしい。誕生直後は3本の毛ではなかった）オバケ。大原家に居候し、いつも正太と行動を共にしている親友の仲。大飯食らい（炊飯器を空にして｢おかわり｣と催促してママに怒られるなどしている。インスタントラーメンはカッポレ一番を愛好する）でお人よし、鈍くさくて頭はあまり良くないが、繊細で落ち込んだり傷ついたりすると、時々家出を企てては、腹を空かせるなどの理由であっさり帰って来る。身長111cm、体重0～35kg、視力は右が3.0で左が2.5。犬が大の苦手だが、嫌っているわけではなく何度か子犬を守ったこともある。また犬から逃げるために、動物園にいるライオンの口の中に隠れたこともある。先述のオバケの能力を一通り持っているが、変身だけは苦手で靴になることくらいが限度（原作では苦手な犬に化けたことがある）。他に、容器の中に入っていると体が容器の形に固まる、眼球を飛び出させることができる（「書類に目を通してくれ」と言われて紙束に眼球を通す場面がある）といった「特技」もある。また、音楽のセンスは皆無で歌唱、器楽共に聴者が頭痛など起こし気持ち悪くなってしまうほど（しかも当人は無自覚）だが、逆にこれが功をなすことも。腹の中にはポケットがあり、口や服の下からどんな物でも出し入れができる。一枚布（バケトロン（バケミロン）という架空の素材。この素材はマジックなどで字や絵をかくことが可能で、脱いて放置しておくと汚れが落ちるが、洗濯すると縮む）に目・口用の穴を開けた白い服（同じ物が何枚もあり、よそ行き用もある）を頭から被っており、実際に見えているのは服を除くと、3本の毛と、足、目、口だけである。また、服の中を見られることは「オバケの国での御法度だ」と言って頑なに嫌っており、中身がどうなっているのかは不明。
U子に対して好意を抱くものの、非常にシャイで好意の伝達方法を間違えてU子を怒らせてしまったこともある。作者いわくQ太郎のモデルは、ペンギンとベビー服であるという。『週刊少年サンデー』で『オバケのQ太郎』の連載が開始した1964年2月28日が誕生日と設定されている。連載当初は毛が10本以上あったが、次第に減って行き「台風Q号」から3本に落ち着いた。これは作画の手間から都合がいいということである。『小学一年生』の懸賞で「オバQ消しゴム」を作ることになり藤子・F・不二雄に造形を頼んだが、もじゃもじゃ頭だと作り難い。そこで、大学では心理学を学んでいた担当の井川浩が「男は奇数女は偶数」というジークムント・フロイトの学説に基づき毛を3本にする提案をしたことが直接のきっかけという。毛の長さは約15cm。最初のシリーズ最終話では単身オバケの世界へと帰って行った。『ドラえもん』での登場については後述。
後年のドラえもんのように数々のSFグッズを取り出すわけでもなく、基本的に消えることと飛ぶことだけの超常能力しか持たないため、子供たちの日常生活にすっぽり同化している。性格的にも、ドラえもんがやや保護者的なのに対し、抜けているところが多い三枚目キャラクターである。ただ、正太を背中に乗せての空中散歩はこの作品の象徴的風景であり、パロディの対象になったり（永野のりこ『GOD SAVE THE すげこまくん!』など）、スーパーや百貨店の屋上遊具に取り入れられたりした。

P子（ピーこ）

声 - 水垣洋子（1作目）、沢田和子（2作目）、三田ゆう子（3作目）
Q太郎の妹。オバケの世界から人間界へ留学、河合家に居候している聡明で可憐なオバケ。Q太郎より頭の出来が良く、化けるのも得意で「グロな化け方」も可能。料理や裁縫は苦手で、ジェンダーに無頓着なところがある（ユカリに自分の役立ちようをアピールする際、「自分が暴漢に化けてボーイフレンドを脅し、ユカリが助けて仲を深める」策を提案するなど）。姿は白の上半身に赤いチェックのスカート、頭の毛は1本で蝶型の飾りを付けている。身長はO次郎とほぼ同じ。P子とユカリがメインのエピソード『オバケのP子日記』というスピンオフ作品もある。

O次郎（オーじろう）

声 - 高坂真琴→桂玲子（2作目）、横沢啓子（3作目）
Q太郎、P子の弟。『新オバケのQ太郎』で登場したキャラクターで、オバケの国へ一度帰っていったQ太郎が、再び人間界へ戻って来た際に連れてきた。Q太郎と共に大原家に居候している。体は丸く黄色(またはピンク)であり、毛は1本でくるっとしている。まだ赤ん坊のオバケなので、「バケラッタ（この言葉は「オバQ音頭」の歌詞から来ている）」しか言えないが、「ナニラッタ?」「バカラッタ！」「ダメラッタ」「アホラッタ」など、多少のバリエーションがある。このため、意思伝達にはQ太郎の翻訳が必要。大原家の人々がQ太郎から「バケラッタ」ごとのニュアンスの違いを教わるエピソードがある。また「ボム！」または「パァ！」と叫ぶことで目の前のあらゆる物を爆発させる特技の持ち主（ライオンを退けたこともある）。手先が器用で、自分で壊した電話を直したり新聞紙で靴下を作ったりできるが、画力は幼稚園児と大差ない（O次郎の絵が漫画のキャラクターのベースになったことはある）。世界中の多くの国名を言えるほど頭はよい（ただし全てバケラッタになる）。化けるのも上手で、クジ運もいい。なかなかの兄思いである。

U子（ユーこ）

声 - 丸山裕子（2作目）、増山江威子（3作目）
人間の世界に憧れてやって来た、小泉家に居候しているおてんば娘のオバケ。柔道に入れ込んでいるが、がさつで乱暴、家事が一切できない。Q太郎が好意を寄せているが、逢うたびにQ太郎を柔道の稽古相手にしたり、家事を任せてしまっている。しかし、内心ではQ太郎に想いを寄せている部分も。喧嘩が異常に強く、正太の同級生のガキ大将・ゴジラでも歯が立たない。怒るとすぐ手を出すところがあり、特にQ太郎には何かあるとすぐ暴行を加える。ギャング映画を愛好したり足で襖を開ける、茶道を習いに行った席でシェーをしてふざける、箏をエレキギターのように弾いたりするなど、典雅、可憐に対する理解がない。太ることを著しく気にしており、それを指摘されると烈火の如く怒りを現にする。化けることもできるが余り上手ではない。また歌も下手である。アニメ版の『新オバケのQ太郎』では、原作と口のデザインが異なる。

ドロンパ

声 - 喜多道枝（1作目）、山本嘉子（2作目）、白石冬美（3作目）
アメリカ・テキサス出身のオバケ。神成家に居候している。アメリカでは大地主の家に住んでいた。頭が良くて運動神経がいい上、さまざまな物・人に化けられる。いつもQ太郎のことをバカにしている。少々ニヒルなひねくれ者だが、実際は寂しがり屋で心優しい。Q太郎がオバケの国へ帰っていた時期には、Q太郎に化けて悪戯をしていたこともあった。体は薄桃色の一体型で、Q太郎と異なり脚もきちんと分かれている。お腹にある赤い星型（脱着可能）が能力の源（直下にある青の三本線で星条旗を象徴している）。一度、その星型を紛失したことがあったが、Q太郎によって取り返された。登場オバケの中で唯一、犬を苦手としないが、糠味噌やたくあんの匂いが大の苦手。シュークリームも苦手と言っているが、「見てると怖いから食べてやる」とたくさん食べていた（まんじゅうこわいのパロディ。似た手口でホットドッグをせしめたこともある）。好物はハンバーガー。P子に思いを寄せているが、デートの際には、P子の身を案ずるQ太郎に、いつも邪魔されている。話のまとめ役が多く、演劇や新聞製作など色々と挑戦するが、Q太郎が引っ掻き回してしまうため長続きしないことが多い。誕生日は3月27日。なお、藤子・F・不二雄大全集版では4巻から登場しているが、掲載ごとに分かれているため、初登場の話は10巻収録である。

ペロンパ

ドロンパの妹。クリッとした大きな目と、ポニーテール、ペロッと出した舌が特徴。O次郎の初恋相手。まだ幼児であり、「ペケポコ」としかしゃべらない。O次郎と会話をする時は、ドロンパからQ太郎と二重通訳。ドロンパと同じく犬を怖がることはない。登場は1回のみ。この時は、趣味の切手集めのために来日した。

X蔵（エックスぞう）

Q太郎、P子、O次郎の父親。Q太郎からは「オバケの国のパパ」と呼ばれている。やや細身で毛が4本、口ひげがある以外はQ太郎にそっくり。Q太郎に似て少々常識外れのオバケ。時折子供達を預かってもらっている大原家へお礼にと、妻のおZと共にやって来ては騒動を起こす。他人の服装を変化させる、新しいステレオを出すなどの力を使ったことがある。

おZ（おゼット）

Q太郎、P子、O次郎の母親。Q太郎からは「オバケの国のママ」と呼ばれている。毛は螺旋状の2本。間の抜けたX蔵を支える。基本はしっかり者だが、おっちょこちょいな所も。なお、父母、妹ともに犬が苦手である。

Y助（ワイすけ）

Q太郎の叔父。Q太郎にチャップリンの髭を生やしたような外見をしている。X蔵と同じくガチャ目。登場は1回だけ（FF新4巻）。この時は、Q太郎を探しに人間界にやってきた。珍しい物を見るとすぐに化けたがり、マシンガンに化けたりしていた。作品中では一度も名前が出てくることはなかったが、『小学六年生』1971年6月号の「オバQ一家とそのなかま」というカットの中に「おじ Y助」と書かれていたことから名前が判明。

Q助（キュウすけ）

Q太郎の祖父。実際は話に上るだけで、未登場（FF17巻）。外観はQ太郎と瓜二つ。約100年程前に人間界に降りてきており、正助の兄からの郵便で大原家の実家の蔵から出てきた古い写真（Q助本人、ドロンパの祖父ボロンパ、正太の高祖父・大原正右衛門）が届いた。Q太郎が見た夢の中で、1860年に正右衛門とその家来と一緒に咸臨丸に乗って、アメリカに渡った。

イナリ　※石森作画

ゴジラの子分。キツネ顔。自宅はクリーニング店を経営。

ブンブク・タヌキ　※石森作画

ゴジラの子分。タヌキ顔。

河伊 伊奈子（かわい いなこ）　※藤本作画

『新オバケのQ太郎』のみに登場した伸一のクラスメート。休日のたびに何人もの男子から誘われるほどのモテモテぶりで、伸一も好意を寄せているが本人は友達感覚でしかない。伸一がスイカを丸呑みできるというのを止めもせず、けしかけたこともある。ミミズとオバケが苦手だったがQ太郎、O次郎とは仲がよい。将来の夢はイラストレーター。

先生　※石森作画

声 - 島香裕（3作目）
正太達の通う小学校のクラス担任。容貌がカバそっくりの中年男性教員。「 - だっちゅうに」、「 - ってな」などが口癖。あだ名は"威張り豚"、"ヒネブタ"。作画を石森・藤子以外が担当している箇所もある。

ヒョーロク　※藤本作画

大原家の隣人。チョビ髭を生やしている成人男性。いわゆる変人でトラブルメーカー。語尾は「 - ニィ」「 - だネィ」。『新オバケのQ太郎』で登場。

岩見（いわみ）さん　※藤本作画

ユカリのボーイフレンド。誕生日は3月10日。『オバケのP子日記』のみ登場。

青山 ミドリ（あおやま ミドリ）　※藤本作画

神成さんの家に下宿してくる20歳前後の女性。美人で心優しく、Q太郎を弟のようにかわいがるが、Q太郎はそんな彼女に対して淡い恋心を抱く。マドモアゼルに連載された作品にのみ登場。なお彼女が出る一連の作品にドロンパは登場しない。

エジサン　※藤本作画

本名は江地三助。発明家を自称するが失敗ばかり。貧乏であるが、昔は金持ちだった。『ウメ星デンカ』にも登場している。

ネコ　※藤本作画

『新オバケのQ太郎』幼年誌版にたびたび登場する大原家の飼い猫。

上記で言及した作画の分担は『オバケのQ太郎』においてのものを記した。学年誌版『オバケのQ太郎』や『新オバケのQ太郎』では石森は参加しておらず、藤子不二雄の2人で描かれている。ただし、『新オバケのQ太郎』における絵の分担は明らかにはされていない。絵柄の違いから、正太と伸一以外の大部分が藤本とされており、中には全て藤本による執筆の作品もある。

大人になりサラリーマンとなった大原正太（正ちゃん）と、15年ぶりに人間界に帰ってきたQ太郎が街角で再会する。正太は既に結婚しており、Q太郎はその家庭に居候することになるのだが、正太の妻は大食らいで厚かましい態度のQ太郎を煙たがる。そんな中、Q太郎が戻って来た事を知った西郷強（ゴジラ）が、かつての仲間達を呼び寄せて飲み会を開く。やがて昔話に花が咲き、「子供の頃の夢よもう一度」と皆で誓い合う。

しかしほどなくして、正太の妻が妊娠していると分かり、前夜の誓いなどすっかり忘れて子供が出来たと浮かれて出勤する正太を見たQ太郎は、もう正ちゃんは子供ではないということを悟り、大原家を後にしてどこかへ飛び去って行く。後にはボロボロになったQ旗が誰にも顧みられることなく残された。

• 高橋尚子 - 「Qちゃん」のあだ名で呼ばれている。その由来は、リクルート（当時）の陸上部新入部員歓迎パーティーで、全身にアルミホイルを巻き、カラオケで『新オバケのQ太郎』の主題歌を歌ったことによる。
• 田代富雄 - 「オバQ」の愛称があった元大洋ホエールズ選手。プロ入りした1973年に間の抜けたような受け答えをしたことから、当時の2軍コーチだった沖山光利に「オバQみたいなヤツだな」と言われたことが「オバQ」と呼ばれた始まりだった。それまで言われていた、その風貌（田代はむしろ目は小さい）や「オバケのように打球が遠くへ飛んでいく」などの説は違うという。当時、打席に立つ時にアニメのテーマ曲がエレクトーンで演奏された時期もあった。
• 栃乃和歌（元・大相撲力士、現・春日野親方） - その風貌と厚い唇から兄弟子の舛田山（現・千賀ノ浦親方）から「Qちゃん」と呼ばれていた。後に、そのあだ名が広まり「角界のオバQ」と呼ばれるようになった。

• いすゞ・BU - 1960年代から1970年代に製造された観光バスで、川崎重工業（1969年までの川崎航空機、のちの川重車体工業）が製造したボディは、前面がQ太郎に似ている（特にヘッドライト周りがQ太郎の唇に似ているという）理由で「オバQ」の愛称が付いた車がある（詳細は該当項目参照）。なお、ユーザー側の希望により、日野自動車や三菱自動車工業（三菱ふそう）のシャーシに同型のボディを架装した例も若干あった。