※本作は、アニメシリーズで初めて放映中にオープニングテーマの歌手が変わった。テレビサイズは第51話まで1番のみ、第52話から1・2・3番を週代わりで流す形式が取られた。

「ゲゲゲの鬼太郎」

第1話から第51話までは泉谷しげる（インデックスミュージック）によるオープニングテーマ。作詞は水木しげる、作曲はいずみたく、編曲は堀井勝美。 このバージョンから映像がデジタル化となる。フュージョン風のアレンジ。泉谷は「鬼太郎の主題歌といえば熊倉一雄さんのイメージが強いので、そっちの方がいいと言われるに決まっている」と語っている。テレビサイズは、イントロに入るシャウトがカットされている（カラオケと同じ状態）。

第52話から第100話まではザ50回転ズ（ワーナーミュージック・ジャパン）によるオープニングテーマ。編曲もザ50回転ズ。 イントロのフレーズは原曲や第4シリーズと同じものを引用しているが、全体的には大幅に印象が異なるロック調のアレンジになっている。この他にも、劇場版用に妖怪横丁レギュラー（鬼太郎〈高山みなみ〉、目玉おやじ〈田の中勇〉、ねずみ男〈高木渉〉、ネコ娘〈今野宏美〉、砂かけ婆〈山本圭子〉、子泣き爺＆ぬりかべ〈龍田直樹〉、一反木綿〈八奈見乗児〉）が歌うバージョンも存在し、番組終了後には鬼太郎ファミリー以外の妖怪横丁レギュラー声優も参加した間奏中台詞付きバージョンも作られた。

「ウラメシ夜（ヤ）」（第1話 - 第26話）

長井秀和（インデックスミュージック）によるエンディングテーマ。作詞はt@28、作曲はUZA、編曲は大野宏明。

「妖怪横丁ゲゲゲ節」（第27話 - 第51話）

スワベジュンイチ（インデックスミュージック）によるエンディングテーマ。作詞は山田ひろし、作曲・編曲は太田美知彦。
声優の諏訪部順一が率いるエンターテインメント・プロジェクトチームが担当。歌詞の内容は、テレビサイズは、劇中に登場する妖怪をワンコーラスで2人ずつ紹介するもの。毎回異なる歌詞と映像もそれに合わせた登場妖怪画像が使われるという珍しいスタイルになっている。すべての歌詞を繋げると1つの曲としては非常に長いものになるため、フルサイズも複数の曲に分割された形になっている。

「カクメイノウタ〜Diggin'〜」（第52話 - 第64話）

ROCK'A'TRENCH（ワーナーミュージック・ジャパン）によるエンディングテーマ。作詞・作曲は山森大輔、編曲はROCK'A'TRENCH。

「夏の魔物」（第65話 - 第76話）

鶴（ワーナーミュージック・ジャパン）によるエンディングテーマ。作詞・作曲は秋野温、編曲は鶴、スパム春日井。

「スターフルーツ」（第77話 - 第89話）

メレンゲ（ワーナーミュージック・ジャパン）によるエンディングテーマ。作詞・作曲はクボケンジ、編曲は上田健司、クボケンジ。

「三日月と北風」（第90話 - 第100話）

HI LOCKATION MARKETS（ワーナーミュージック・ジャパン）によるエンディングテーマ。作詞は浅田信一、作曲・編曲は本間昭光。
映像では2008年に公開された映画『日本爆裂!!』のシーンが映し出されている。最終話では初代OPの一部映像やこれまでのストーリー一部の総集編となっており、途中から鬼太郎が視聴者に向けてコメントした。最後の映像は鬼太郎ファミリーとその仲間たちの集合映像で番組を締めくくった。

劇場版 ゲゲゲの鬼太郎 日本爆裂!! （2008年12月20日）

『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪パニックアドベンチャー 〜激闘!! お台場入道〜』 2007年7月14日から9月2日まで開催されたフジテレビ主催のイベント「お台場冒険王」用に制作。フジテレビ本社球体展望室「はちたま」にて上映された。翌年には、再編集を施した『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪パニックアドベンチャー 〜激闘!! 芦ノ湖入道〜』が箱根園の施設「フジテレビショップ＆シアター」で上映された。 『ゲゲゲの鬼太郎 カランコロン3Dシアターじゃ』 2007年8月11日より富士急ハイランド他で上映された3D立体映像アニメーション。上映時間約15分。サブタイトルの「冒険！妖怪横丁 -妖怪王ベリアル-」の名称でも上映された。ホール上映中心に2D版の上映も時折行われている。脚本は木原大輔、絵コンテ・演出は中尾幸彦、作画監督は薮本陽輔、原画はさとうげん、市川吉幸、薮本陽輔。 『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪JAPANラリー3D』 2008年7月12日より約3年間上映。サンリオピューロランドおよびハーモニーランドの体感シアター「夢のタイムマシン」で上映されていた4Dアトラクション。上映時間約20分。監督は中村健治。

『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪パニックアドベンチャー 〜激闘!! お台場入道〜』

2007年7月14日から9月2日まで開催されたフジテレビ主催のイベント「お台場冒険王」用に制作。フジテレビ本社球体展望室「はちたま」にて上映された。翌年には、再編集を施した『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪パニックアドベンチャー 〜激闘!! 芦ノ湖入道〜』が箱根園の施設「フジテレビショップ＆シアター」で上映された。

『ゲゲゲの鬼太郎 カランコロン3Dシアターじゃ』

2007年8月11日より富士急ハイランド他で上映された3D立体映像アニメーション。上映時間約15分。サブタイトルの「冒険！妖怪横丁 -妖怪王ベリアル-」の名称でも上映された。ホール上映中心に2D版の上映も時折行われている。脚本は木原大輔、絵コンテ・演出は中尾幸彦、作画監督は薮本陽輔、原画はさとうげん、市川吉幸、薮本陽輔。

『ゲゲゲの鬼太郎 妖怪JAPANラリー3D』

2008年7月12日より約3年間上映。サンリオピューロランドおよびハーモニーランドの体感シアター「夢のタイムマシン」で上映されていた4Dアトラクション。上映時間約20分。監督は中村健治。

発売元・販売元：ハピネット

地上アナログ放送版では見ることが出来なかったオリジナル画面サイズ（16:9サイズ）で収録。セル用は第52話以降を「第二夜」として巻数をリセットしているが、レンタル用は第一夜・第二夜の区分をせず、巻数もリセットされていない。

第一夜
巻数	発売日	品番	収録話
1	2007年8月11日	BIBA-7601	第1話 - 第2話
2	2007年9月26日	BIBA-7602	第3話 - 第5話
3	2007年10月26日	BIBA-7603	第6話 - 第8話
4	2007年11月22日	BIBA-7604	第9話 - 第11話
5	2007年12月21日	BIBA-7605	第12話 - 第14話
6	2008年1月25日	BIBA-7606	第15話 - 第17話
7	2008年2月22日	BIBA-7607	第18話 - 第20話
8	2008年3月21日	BIBA-7608	第21話 - 第23話
9	2009年3月21日	BIBA-7609	第24話 - 第26話
10	2009年4月25日	BIBA-7610	第27話 - 第29話
11	2009年4月25日	BIBA-7611	第30話 - 第32話
12	2009年5月30日	BIBA-7612	第33話 - 第35話
13	2009年5月30日	BIBA-7613	第36話 - 第38話
14	2009年6月27日	BIBA-7614	第39話 - 第41話
15	2009年6月27日	BIBA-7615	第42話 - 第44話
16	2009年7月25日	BIBA-7616	第45話 - 第47話
17	2009年7月25日	BIBA-7617	第48話 - 第49話
18	2009年7月25日	BIBA-7618	第50話 - 第51話

第二夜
巻数	発売日	品番	収録話
1	2008年8月8日	BIBA-7641	第52話 - 第53話
2	2008年9月26日	BIBA-7642	第54話 - 第56話
3	2008年10月24日	BIBA-7643	第57話 - 第59話
4	2008年11月28日	BIBA-7644	第60話 - 第62話
5	2008年12月21日	BIBA-7645	第63話 - 第65話
6	2009年1月30日	BIBA-7646	第66話 - 第68話
7	2009年2月27日	BIBA-7647	第69話 - 第71話
8	2009年3月27日	BIBA-7648	第72話 - 第74話
9	2009年3月27日	BIBA-7649	第75話 - 第77話
10	2009年4月24日	BIBA-7650	第78話 - 第80話
11	2009年4月24日	BIBA-7651	第81話 - 第83話
12	2009年5月22日	BIBA-7652	第84話 - 第86話
13	2009年5月22日	BIBA-7653	第87話 - 第89話
14	2009年6月26日	BIBA-7654	第90話 - 第92話
15	2009年6月26日	BIBA-7655	第93話 - 第95話
16	2009年7月17日	BIBA-7656	第96話 - 第98話
17	2009年7月17日	BIBA-7657	第99話 - 第100話

BOX

タイトル	発売日	品番	収録話
ゲゲゲの鬼太郎 DVD-BOX1	2010年2月19日	BIBA-9361	第1話 - 第51話
ゲゲゲの鬼太郎 DVD-BOX2	2010年8月27日	BIBA-9362	第52話 - 第100話

劇場版

劇場版 ゲゲゲの鬼太郎 日本爆裂!!
発売日	規格品番
	BD限定版	BD通常版	DVD限定版	DVD通常版
2009年6月21日	BSTD-2962	BSTD-2961	DSTD-02962	DSTD-02961

ゲゲゲの鬼太郎 セレクション ニャニャニャのネコ娘

2009年8月28日発売。品番：BIBA-7800
ネコ娘に焦点を当てたエピソードを収録。DVD2枚組。

• マキシシングル
• ゲゲゲの鬼太郎（2007年5月9日発売、品番：NECM-10064）
• 泉谷しげるの歌う主題歌とその別バージョン「ゲゲゲの鬼太郎 其之二」を収録。発売元はインデックスミュージック。
• ウラメシ夜（2007年5月16日発売、品番：NECM-10065）
• 長井秀和の歌うエンディングテーマとイメージソング「妖怪子守唄」を収録。発売元はインデックスミュージック。
• いたずら（2007年9月26日発売、品番：NECM-10076）
• 鬼太郎役の高山みなみが歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• NADE-NADEして（2007年9月26日発売、品番：NECM-10077）
• ねこ娘役の今野宏美が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 路地裏ブルース（2007年9月26日発売、品番：NECM-10078）
• ねずみ男役の高木渉が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 夢のリフォーム大作戦（2007年9月26日発売、品番：NECM-10079）
• 砂かけばばあ役の山本圭子が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 子泣きのララバイ（2007年9月26日発売、品番：NECM-10080）
• 子泣きじじい役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• かぞくがいちばん（2007年9月26日発売、品番：NECM-10081）
• ぬりかべ役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• おいどん てんがらもん（2007年9月26日発売、品番：NECM-10082）
• 一反もめん役の八奈見乗児が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 妖怪横丁ゲゲゲ節（2007年11月21日発売、品番：NECM-10086）
• スワベジュンイチ（諏訪部順一が率いる音楽プロジェクト）の歌うエンディングテーマ2種を収録。CMでは鬼太郎のコスプレをした諏訪部が渋谷の街中に出現する。発売元はインデックスミュージック。
• 妖怪横丁ゲゲゲ節〜諸国漫遊編〜（2008年1月9日発売、品番：NECM-10088）
• スワベジュンイチの歌うエンディングテーマのうち、前シングルで歌われなかった部分を収録。発売元はインデックスミュージック。
• ゲゲゲの鬼太郎（2008年5月21日発売、品番：WPCL-10474）
• ザ50回転ズの歌う主題歌の、フルサイズとTVサイズ3種を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• カクメイノウタ〜Diggin'〜（2008年5月21日発売、品番：WPCL-10469）
• ROCK'A'TRENCHの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• 夏の魔物（2008年7月9日発売、品番：WPCL-10483）
• 鶴の歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• スターフルーツ（2008年12月3日発売、品番：WPCL-10629）
• メレンゲの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• REAL（2008年12月24日発売、品番：WPCL-10634）
• HI LOCKATION MARKETSが歌うエンティングテーマ「三日月と北風」を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• ゲゲゲの鬼太郎・妖怪パラパラ（2010年2月19日発売、品番：WM-0637）
• 第5シリーズ出演声優陣が企画制作した、妖怪たちがパラパラに挑戦するスピンオフCD。発売元はウェーブマスター。
• アルバム
• 発売元はインデックスミュージック。
• ゲゲゲの鬼太郎 オリジナル・サウンドトラック（2007年8月22日発売、品番：NECA-30200）
• 主題歌（TVサイズ）とBGMを収録した音楽集。
• ゲゲゲの鬼太郎 オリジナル・サウンドトラック弐（2008年2月27日発売、品番：NECA-30215）
• エンディングテーマ「妖怪横丁ゲゲゲ節」サントラオリジナルバージョン〜目玉おやじとマヒマヒ編〜（歌：スワベジュンイチ）が収録される。また、ボーナストラックには「吸血鬼エリート」「ファイヤーダンス」「妖怪マヒマヒのハワイアンセンター」「骨女」を収録。
• ゲゲゲの鬼太郎〜妖怪歌謡集（ベスト）〜（2008年3月23日発売、品番：NECA-30219）
• キャラクターソングやオープニングテーマ「ゲゲゲの鬼太郎」エンディングテーマ「ウラメシ夜（ヤ）」「妖怪横丁ゲゲゲ節」等14曲を収録したベストアルバム。
• 劇場版 ゲゲゲの鬼太郎 日本爆裂!! オリジナル・サウンドトラック（2009年6月24日発売、品番：COCX-35634）
• 劇場公開された「日本爆裂!!」の音楽を収録したサウンドトラック。キャラクター総参加の新録音主題歌も同時収録。発売元はコロムビアミュージックエンタテインメント。

• ゲゲゲの鬼太郎（2007年5月9日発売、品番：NECM-10064）
• 泉谷しげるの歌う主題歌とその別バージョン「ゲゲゲの鬼太郎 其之二」を収録。発売元はインデックスミュージック。
• ウラメシ夜（2007年5月16日発売、品番：NECM-10065）
• 長井秀和の歌うエンディングテーマとイメージソング「妖怪子守唄」を収録。発売元はインデックスミュージック。
• いたずら（2007年9月26日発売、品番：NECM-10076）
• 鬼太郎役の高山みなみが歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• NADE-NADEして（2007年9月26日発売、品番：NECM-10077）
• ねこ娘役の今野宏美が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 路地裏ブルース（2007年9月26日発売、品番：NECM-10078）
• ねずみ男役の高木渉が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 夢のリフォーム大作戦（2007年9月26日発売、品番：NECM-10079）
• 砂かけばばあ役の山本圭子が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 子泣きのララバイ（2007年9月26日発売、品番：NECM-10080）
• 子泣きじじい役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• かぞくがいちばん（2007年9月26日発売、品番：NECM-10081）
• ぬりかべ役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• おいどん てんがらもん（2007年9月26日発売、品番：NECM-10082）
• 一反もめん役の八奈見乗児が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。
• 妖怪横丁ゲゲゲ節（2007年11月21日発売、品番：NECM-10086）
• スワベジュンイチ（諏訪部順一が率いる音楽プロジェクト）の歌うエンディングテーマ2種を収録。CMでは鬼太郎のコスプレをした諏訪部が渋谷の街中に出現する。発売元はインデックスミュージック。
• 妖怪横丁ゲゲゲ節〜諸国漫遊編〜（2008年1月9日発売、品番：NECM-10088）
• スワベジュンイチの歌うエンディングテーマのうち、前シングルで歌われなかった部分を収録。発売元はインデックスミュージック。
• ゲゲゲの鬼太郎（2008年5月21日発売、品番：WPCL-10474）
• ザ50回転ズの歌う主題歌の、フルサイズとTVサイズ3種を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• カクメイノウタ〜Diggin'〜（2008年5月21日発売、品番：WPCL-10469）
• ROCK'A'TRENCHの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• 夏の魔物（2008年7月9日発売、品番：WPCL-10483）
• 鶴の歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• スターフルーツ（2008年12月3日発売、品番：WPCL-10629）
• メレンゲの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• REAL（2008年12月24日発売、品番：WPCL-10634）
• HI LOCKATION MARKETSが歌うエンティングテーマ「三日月と北風」を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。
• ゲゲゲの鬼太郎・妖怪パラパラ（2010年2月19日発売、品番：WM-0637）
• 第5シリーズ出演声優陣が企画制作した、妖怪たちがパラパラに挑戦するスピンオフCD。発売元はウェーブマスター。

泉谷しげるの歌う主題歌とその別バージョン「ゲゲゲの鬼太郎 其之二」を収録。発売元はインデックスミュージック。

長井秀和の歌うエンディングテーマとイメージソング「妖怪子守唄」を収録。発売元はインデックスミュージック。

鬼太郎役の高山みなみが歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

ねこ娘役の今野宏美が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

ねずみ男役の高木渉が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

砂かけばばあ役の山本圭子が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

子泣きじじい役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

ぬりかべ役の龍田直樹が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

一反もめん役の八奈見乗児が歌うキャラクターソングを収録。発売元はインデックスミュージック。

スワベジュンイチ（諏訪部順一が率いる音楽プロジェクト）の歌うエンディングテーマ2種を収録。CMでは鬼太郎のコスプレをした諏訪部が渋谷の街中に出現する。発売元はインデックスミュージック。

スワベジュンイチの歌うエンディングテーマのうち、前シングルで歌われなかった部分を収録。発売元はインデックスミュージック。

ザ50回転ズの歌う主題歌の、フルサイズとTVサイズ3種を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。

ROCK'A'TRENCHの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。

鶴の歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。

メレンゲの歌うエンディングテーマを収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。

HI LOCKATION MARKETSが歌うエンティングテーマ「三日月と北風」を収録。発売元はワーナーミュージック・ジャパン。

第5シリーズ出演声優陣が企画制作した、妖怪たちがパラパラに挑戦するスピンオフCD。発売元はウェーブマスター。

発売元はインデックスミュージック。

• ゲゲゲの鬼太郎 オリジナル・サウンドトラック（2007年8月22日発売、品番：NECA-30200）
• 主題歌（TVサイズ）とBGMを収録した音楽集。
• ゲゲゲの鬼太郎 オリジナル・サウンドトラック弐（2008年2月27日発売、品番：NECA-30215）
• エンディングテーマ「妖怪横丁ゲゲゲ節」サントラオリジナルバージョン〜目玉おやじとマヒマヒ編〜（歌：スワベジュンイチ）が収録される。また、ボーナストラックには「吸血鬼エリート」「ファイヤーダンス」「妖怪マヒマヒのハワイアンセンター」「骨女」を収録。
• ゲゲゲの鬼太郎〜妖怪歌謡集（ベスト）〜（2008年3月23日発売、品番：NECA-30219）
• キャラクターソングやオープニングテーマ「ゲゲゲの鬼太郎」エンディングテーマ「ウラメシ夜（ヤ）」「妖怪横丁ゲゲゲ節」等14曲を収録したベストアルバム。
• 劇場版 ゲゲゲの鬼太郎 日本爆裂!! オリジナル・サウンドトラック（2009年6月24日発売、品番：COCX-35634）
• 劇場公開された「日本爆裂!!」の音楽を収録したサウンドトラック。キャラクター総参加の新録音主題歌も同時収録。発売元はコロムビアミュージックエンタテインメント。

主題歌（TVサイズ）とBGMを収録した音楽集。

エンディングテーマ「妖怪横丁ゲゲゲ節」サントラオリジナルバージョン〜目玉おやじとマヒマヒ編〜（歌：スワベジュンイチ）が収録される。また、ボーナストラックには「吸血鬼エリート」「ファイヤーダンス」「妖怪マヒマヒのハワイアンセンター」「骨女」を収録。

キャラクターソングやオープニングテーマ「ゲゲゲの鬼太郎」エンディングテーマ「ウラメシ夜（ヤ）」「妖怪横丁ゲゲゲ節」等14曲を収録したベストアルバム。

劇場公開された「日本爆裂!!」の音楽を収録したサウンドトラック。キャラクター総参加の新録音主題歌も同時収録。発売元はコロムビアミュージックエンタテインメント。

• テレビアニメ版 ゲゲゲの鬼太郎テーマコレクション（2007年9月26日発売、品番：NECA-30203）
• 第1シリーズから第5シリーズ第26話までの各主題歌を収録。第1、第2シリーズの曲はTVサイズでの収録（ただし、歌詞はフルサイズで掲載されている）で、「鬼太郎オリンピック」は未収録。発売元はインデックスミュージック。
• ゲゲゲの鬼太郎・コレクション（2008年3月23日発売、品番：NECA-30225）
• アニメ放送開始以来、多様なジャンルのアーティストがカバーしてきた主題歌「ゲゲゲの鬼太郎」を収録。発売元はインデックスミュージック。
• ゲゲゲの鬼太郎 歴代主題歌集（2019年3月20日発売、品番：COCX-40763）
• 第1シリーズから第6シリーズのオープニング主題歌や、カヴァー・ヴァージョンなどを収録。発売元は日本コロムビア。

第1シリーズから第5シリーズ第26話までの各主題歌を収録。第1、第2シリーズの曲はTVサイズでの収録（ただし、歌詞はフルサイズで掲載されている）で、「鬼太郎オリンピック」は未収録。発売元はインデックスミュージック。

アニメ放送開始以来、多様なジャンルのアーティストがカバーしてきた主題歌「ゲゲゲの鬼太郎」を収録。発売元はインデックスミュージック。

第1シリーズから第6シリーズのオープニング主題歌や、カヴァー・ヴァージョンなどを収録。発売元は日本コロムビア。