1998年頃から、本作品関連のフィギュアやキーホルダーなどが発売されるようになり、翌1999年にはテレビアニメ（以下、テレビシリーズ）の放送も開始（詳細は後述）。アニメ化以降はさらにその商品の規模を拡大し、着ぐるみショーを開催するところまで存在していた。またテレビマガジンでもアニメ化以前に、フィギュアを使用した絵本調の物語が連載された。原作の連載末期に当たる2001年4月には、奥村遊機から本作品を題材にしたパチンコ機『CRサイボーグクロちゃん』がリリースされている。

原作終了からおよそ10年が経過した2012年1月には、『復活！サイボーグクロちゃん ガトリングセレクション』、同年7月に『復活！サイボーグクロちゃん ガトリングセレクション リローデッド』が発売。いずれも新作のストーリーが掲載されており、後述の新装版にも3巻と5巻に収録された。2015年11月には、作中（第1巻のみ作後）の出来事に至るまでを描いた新作を収録した、新装版の刊行も開始。第1巻の帯には、同じ名前であるお笑い芸人のクロちゃんがコメントを寄せている。この新装版刊行に当たっては、作中にスヌーピーのぬいぐるみが登場するシーンではぬいぐるみにモザイクがかけられており、ミーの台詞も改変されている。2016年1月23日には新装版発売を記念したイベントも開催され、古澤徹や大本眞基子、坂本千夏らテレビシリーズのキャスト陣も複数出演。放送当時を振り返ってのトークの他、原作の最終回「みんな一緒に‥‥」の朗読も行われた。

この他、2014年にはLINEのスタンプも発売された。

テレビシリーズの放送期間も末期に差し掛かっていた2001年1月、制作会社のパブリック&ベーシックが出資方式での予算集めが滞ったことを受け、アニメの実制作を請け負っていたスタジオボギーとともに倒産。これによりテレビシリーズは前述した最終的な予定に沿っての制作が不可能になり、1月6日放送分（第66話）までで未完に終わった。スタッフの高田耕一によると、2000年12月28日に制作中止が通達され、その時点では第71話の絵コンテが完成していた段階だったという。また第66話以降に放送予定であったエピソードのうち、第70話までは『テレビマガジン』にてタイトルと作中のイラストが掲載されている。

突然の放送中止に伴い、次番組『仰天人間バトシーラー』放送開始までの期間は、セレクションと題した既放送分の再放送で対応。最終回となった第66話のテレビ東京での本放送時は、次回へ続くことを示すナレーションの部分からカットされ、予告パートでもセレクションへの切替のみが伝えられた。

ドクター剛役の古澤徹は、本人曰くいろいろ深刻な時期での起用だったといい、自分の演じていたキャラクターである剛を非常に気に入っており、続編を切望している。

• 原作：横内なおき
• 企画：パブリック&ベーシック
• プロデューサー：高柳明史（テレビ愛知）、松浦公基（パブリック&ベーシック）
• 監督：高本宣弘
• シリーズ構成：山本優
• キャラクターデザイン：島袋美由紀
• メカニックデザイン：飯村一夫
• 美術監督：宮前光春
• 色彩設計：田中直人
• 撮影監督：沖野雅英 → 小林慎吾
• 音響監督：松浦典良
• 音響制作：GEN
• 音楽：若草恵、荒川敏行
• 音楽プロデューサー：斎藤裕二
• 音楽制作：イマジン
• 制作プロデューサー：木下真弓、土屋貴彦
• 番組広報：横田由里香（テレビ愛知）
• 動画チェック：宮田さおり、にしだまゆみ、藤岡正宣、朴機完、高橋英雄
• 動画：孝仁動画、進藤プロダクション、ECHO、F.A.Tインターナショナル、HAHNSHINCOAP、年代動画育視公司、HEEWON、HYOIN、他
• 色指定：野地弘納、石川直樹、横田こずえ、千葉智子他
• 仕上検査：野地弘納、田中直人、横田こずえ、千葉智子他
• 　特殊効果：前川孝、榊原豊彦、新井正春、他
• 仕上：スタジオトイズ、孝仁動画、ECHO、スタジオaB、年代動画育視公司、HEEWON、HYOIN、他
• 背景：獏プロダクション、スタジオパレット、スタジオMAO、星山企画
• 撮影：エースクリエイション、スタジオドリーム、ティ・ニシムラ、HAHNSHINCOAP
• デジタル制作管理：久保太郎
• 現像：東京現像所
• デジタル編集：堀口和彦、篠田和宏、伊藤宣隆、宮田健太郎、遠藤知洋、佐分利屋現、他
• ビデオ編集：ビジョンユニバース
• 効果：伊藤克己
• 録音：丸山光義
• 音響助手：蟹崎佳世
• 制作デスク：馬見塚芳枝
• 録音スタジオ：GEN
• 音響制作：現
• 制作担当：橋詰誠
• 制作進行：入部真子、遠藤宏栄、笹原司郎、比留間信、阿見栄一、松下幸一
• 設定制作：濱先容子
• 文芸担当：小瀬敬子
• 制作協力：スタジオザイン、オフィス蒼、博英
• アニメーション制作：スタジオボギー
• 制作：テレビ愛知、パブリック&ベーシック

• テレビ東京系列局
• テレビ愛知（制作局） - 土曜8:00 - 8:30
• テレビ北海道
• テレビ東京
• テレビ大阪
• テレビせとうち
• TVQ九州放送
• 沖縄テレビ（遅れネット）
• 山形テレビ 土曜 6:00 - 6:30（遅れネット）

• テレビ愛知（制作局） - 土曜8:00 - 8:30
• テレビ北海道
• テレビ東京
• テレビ大阪
• テレビせとうち
• TVQ九州放送

• 『サイボーグクロちゃん:最強打ちまくり音楽大図鑑 TV ― オリジナル・サウンドトラック』（日本コロムビア）2000年6月21日
• 『サイボーグクロちゃん ガトリングミックス』（日本コロムビア）2000年11月18日
• 「サイボーグクロちゃん」〈コロちゃんパック〉（日本コロムビア）2000年5月20日

2022年現在、テレビシリーズの映像ソフトとしては以下のVHSのみがリリースされている。発売元はパブリック&ベーシック、販売元はミュージックガイド社（市販版）、メディアファクトリー（レンタル版）。パブリック&ベーシックの倒産によりビデオ化も中途で打ち切られ、第53話と第55話以降はソフト化されていない。

• テレビ愛知：2010年4月 - 2011年4月17日（毎週日曜6:30 - 7:00、第49話まで）
• テレビ埼玉：2015年7月20日 - 2016年10月31日（毎週月曜18:00 - 18:30）

• アニマックス（第65話まで）
• AT-X：2014年12月 - 2016年4月

この他再放送ではないものの、2015年5月2日に放送されたアニソン・アカデミー（NHK-FM）内でOPが流された。

2022年現在、アニメ放題やU-NEXT、Amazonビデオなどの各種動画サービスにて、テレビシリーズ全話の配信が実施されている。またYouTubeでも講談社の公式チャンネルにて、本作品の電子書籍化や『コミックボンボン』のWeb雑誌化を記念し、以下の日程で無料配信が行われた。

• 2016年12月16日 - 2017年1月9日（ボンボンTV）
• 2017年7月21日 - 9月3日（キッズボンボン）

• 残酷描写や過激な台詞、核や原子力にまつわる物は全体的にカットされている。他にも、原作でよく見かける「殺してやる！」や「死ね！」などの暴言もカットされ、改変されている（「あのハゲ殺したい」➡「あの馬鹿取っちめたい」、「撃ち殺せよ」➡「（その地位から）引きずり下ろせよ」など）。また原作で稀にある下ネタもカットや緩和されている。
• これら以外にも、味方（ミッキー6型の子分やニャンニャンアーミー18号など）を殺害するネタも全体的にカットされている。
• いくつかのパロディ風刺ネタがカットされているが、例外として鈴木の愛称がジムだったり、ロミオとジュリエットの名前はそのまま使われたり、台詞では「アムロ、いきまーす！（機動戦士ガンダム）」「今のパンダはたれてなくちゃ駄目（たれぱんだ）」「機械の身体は欲しくないかい？（銀河鉄道999）」などのパロネタはそのまま使用された。
• 登場人物を理不尽に襲うネタは色々と変更や緩和されている。
• 例として、滝沢が生徒を襲わない、コタローの父の初登場回でラストにクロが襲うのが偽警官になっている、など。
• 第1話にて燃料切れの際に飲んだ燃料が、原作ではラジコン、テレビシリーズではバイクのそれになっている。
• 第1話にて、原作では数十体のニャンニャンアーミーが全て同じ外見だったのに対し、テレビシリーズでは2 - 5号の姿が後に登場する個別デザインと同じになり、それに合わせて6号以降も全員が個性的な見た目になっている。
• プーリィの扱いは、原作では野良犬、テレビシリーズでは飼い犬となっている。物語終了後飼い主が引っ越してしまい、プーリィともその後会えなくなるという結末だった。この時クロちゃんは原作にて剛くんに矢で射られ瀕死の状態にさせられるが、テレビシリーズではハンマーで気絶させられる。
• 原作の地獄のハイウェイ編で、ミーくんは本来チップを残して影も形もなくなるが、テレビシリーズでは頭一つで残っている。その後首が取れるという描写はなくなった。
• 原作のキッド編の1話で、ネコが突然失踪する事件を「ネコ狩り」と呼んでいたが、テレビシリーズでは「ネコキャッチ」になっている。その際チンピラが使う銃も改造拳銃ではなくトリモチ弾となっている。さらにこの事件を引き起こした黒幕が天童ということになっている。
• ナナがアルバイトをする回では、原作だとクロは最後のページでようやくナナを見つけるが、テレビシリーズでは脅迫しているシーンでナナが強盗犯だと気づき、最後には警察に攻撃している。
• 原作では、がんばれミーくん2号を壊そうとしたときにチエコがデートを台無しにされたことになっているが、テレビシリーズでは真・暴走クロちゃんが暴れているときにデートを台無しにされたことになっている。
• スモールライターで二回目にコタローと剛を小さくするときに、原作では全員に「急げ」と殴られているが、テレビシリーズではミーくんが怒った後ナナがミサイルで脅している。
• 原作で、ドッチはマタタビに対して「俺も道具ぐらい使えるんだぜ」と言った後ナイフで刺しているが、テレビシリーズでは「俺だって二本足で立てるんだぜ」と言った後マタタビを突き落としている。
• クロとミーの合体は、原作ではあまり見られなかったのに対し、テレビシリーズではアニメオリジナルのエピソードでほぼ毎回合体するなど、全体的に増加している。
• 前述の通り、テレビシリーズでは本来原作においてミー、剛、コタローの3名が登場しない回であっても、あえて出演させているエピソードがあり、登場する回では話の内容も大きく改変されている。例としてヘビビンガー登場編でクロは本物の鷹に捕まり、銃で脅して手伝わせているが、テレビシリーズでは鷹が剛の作った搭乗型飛行メカということになっている。また、コタローが登場していない初期のエピソードのいくつかが後回しにされたため、それらのエピソードにおいて剛やミーに混じってコタローが登場する回がある。反面、マタタビは原作で登場する回であっても出演がないという回があったり、登場しても台詞がないということがあった。
• 玩具やゲームとのタイアップで、テレビシリーズでは原作では使用しない武装が数多く存在した。真・暴走クロちゃんはその代表格である。

• これら以外にも、味方（ミッキー6型の子分やニャンニャンアーミー18号など）を殺害するネタも全体的にカットされている。

• 例として、滝沢が生徒を襲わない、コタローの父の初登場回でラストにクロが襲うのが偽警官になっている、など。

ゲームボーイカラー専用ソフト。2000年3月23日発売。復活したデビルを倒すため、クロちゃんが立ち上がるという内容のストーリー。テレビシリーズでも、構成が違うもの同内容のエピソードが放映された。また、TVCMも放映された。

第1作目と同じくゲームボーイカラー専用ソフトで、続編と銘打たれているもののストーリー面でのつながりはない。ホワイトウッズ戦で助けたブッチ達に助けを求められ、再びホワイトウッズとの戦いに挑みにいくという内容。当初はバイスが登場するという話もあり異世界編ステージも導入されたが、登場しなかった。また、人気キャラクターであるマタタビが登場しなかった。コミックボンボン読者から応募したクロポンを採用しており、エンドクレジットには採用者名が書かれている。テレビシリーズの放送期間中であったにもかかわらずテレビCMは無く、目立った宣伝は『コミックボンボン』誌上でしか行われなかった。

GB版の発売、並びにテレビシリーズの終了から約2年が経過して発売された、シリーズ初のプレイステーション専用ゲーム。コナミ39シリーズとして発売され、3900円というゲームボーイソフト以下の低価格で買えるゲームだった。同作品はほぼフルボイスとなっているが、テレビシリーズのキャストと同じ声優は主役猫3匹のクロ、ミー、マタタビのみで、それ以外のキャストは全員刷新されている。GB版でプレイヤーとして使用できなかったマタタビが新たに使用可能になった他、GB版ではテレビシリーズの映像からの流用だったゲームパッケージは、同作品では原作者の横内なおきが新たに描き下ろしたものが用いられている。

以下、メイン装備を装備A、格闘装備を装備B、火炎放射系を装備C、ハンマー系を装備D、レーザー系を装備E、バズーカ系を装備Fとそれぞれ表記する。

奥村遊機より2001年2月に発表され、同年4月頃に導入されたCR版。リーチアクションが多数あり、公式サイトではリーチアクションのムービーも見ることができた。大当り画面では、テレビシリーズの主題歌が流れ、映像もOP映像でクロちゃんとミーくんが撃ちまくっているものが流れる。

• 『ロボットポンコッツ』（ゲームボーイカラー用ソフト、ハドソン、1998年12月4日）
• 大電波塔に出てくる「ニャン」というロボポンに赤外線を当てるとクロに進化する。
• 『ロボットポンコッツ ボンボンバージョン』（ゲームボーイカラー用ソフト、ハドソン、1999年12月24日）
• 『ロボットポンコッツ MOONバージョン』（ゲームボーイカラー用ソフト、ハドソン）
• 『ロボットポンコッツ64 〜七つの海のカラメル〜』（NINTENDO64用ソフト、ハドソン、1999年12月24日）
• クロの入ったデータでプレイすると登場。
• 『キャットバスターズ』（スマートフォン向けアプリ、Happy Elements K.K、2017年3月13日）
• 期間限定コラボとして、クロ・ミー・マタタビ・ナナ・ダンク&コタロー・ニャンニャンアーミー2号&3号が登場。
• 『メダロットS』（スマートフォン向けアプリ、SoWhat、2022年3月3日）
• 期間限定コラボとして、クロをモチーフにしたメダロット「ブラックキッド」とミーをモチーフにしたメダロット「ミーアーミー」が登場。

• 大電波塔に出てくる「ニャン」というロボポンに赤外線を当てるとクロに進化する。

• クロの入ったデータでプレイすると登場。

• 期間限定コラボとして、クロ・ミー・マタタビ・ナナ・ダンク&コタロー・ニャンニャンアーミー2号&3号が登場。

• 期間限定コラボとして、クロをモチーフにしたメダロット「ブラックキッド」とミーをモチーフにしたメダロット「ミーアーミー」が登場。