鉄道駅をイメージした男性擬人化で、登場人物のプロフィールにおける生年月日や住所は当該駅のものと同一となっている。彼ら1人1人のキャラクターにはそれぞれの駅のエピソードが反映されているので、それぞれの駅に因んだ知識を高めることができる。なお、擬人化された駅たちは『エキメン』と呼ばれる。

企画の考案者は実業家の有馬あきこで、彼女が集めた女性7人が企画の中心を担っている。キャラクターデザインは甲斐智久が担当。当初3人の候補がいたが、乙女ロードで歩行者にアンケートを取った結果、甲斐智久に決定したという経緯がある。

またテクノバンドSUPER BELL"Zの車掌DJこと野月貴弘も指導運転手（スタッフ）として、プロジェクトに関わっている。

『ミラクル☆トレイン〜中央線へようこそ〜』のタイトルで、各メディアミックスが進行中。メインキャラクターとして、東京、新宿、中野、吉祥寺、立川の各駅を擬人化した5名が設定されている。

2009年2月28日に公式サイトがオープンし、同年3月2日よりウェブコミック誌『YOMBAN』にてウェブコミックが連載開始された。またノベルも3月16日より『YOMBAN』で連載開始。その後ウェブコミックとノベルは4月23日に公式サイトへと移籍した。作者は.east cafe（シナリオ：青崎純、作画：yucca.の女性ユニット）。なお、ノベルでは話の冒頭にイントロダクションボイスが入っている。またウェブコミックは話に関連した鉄道トリビアが傍らに書かれているので、漫画を読みながら鉄道関連の事柄に詳しくなることが出来る。

2009年4月10日にアニメ化が発表されたが、テレビアニメ化が決定したのは後述の大江戸線版であった。しかし同年8月17日開催のコミックマーケット76初日、『ミラクル☆トレイン』ブースにて「ミラ☆コレ 〜ミラクル☆トレイン アニメDVD&ドラマCDスペシャルコレクション〜」が発売された（追加販売が行なわれていた他、コミックマーケット77でも販売された）。詳細はOVA「ミラ☆コレ」を参照。

大江戸線版が発表されて以降ウェブコミックの連載は途絶えていたが、2009年10月6日に一時復活した。2010年11月5日からは中央線版サイトではなく、ミラクル☆トレイン全般の親サイトにこねり～の作画のコミックが掲載されている。なお、中央線版サイトは公開終了し、掲載作品の再掲載や書籍への収録はなかったので、現在は閲覧できない。

『ミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜』のタイトルで、各メディアミックスが進行中。メインキャラクターとして、都庁前、新宿、六本木、汐留、月島、両国の各駅を擬人化した6名が設定されている。

2009年6月2日に公式サイトがオープンし、ウェブコミックとノベルの連載が開始された。ウェブコミック作画はほづみりや、ノベルテキストは関涼子、星宮えりなが担当。また、6月10日発売のアニメ情報誌『PASH!』（主婦と生活社）2009年7月号よりオールカラー4コマ漫画の連載が開始されている。作者はウェブコミックと同じく、ストーリーを.east cafeが担当し作画をほずみりやが担当。漫画は中央線版と同じく、話に関連した鉄道トリビアが傍らに書かれているので、読みながら鉄道関連の事柄に詳しくなることが出来る。

2009年8月10日にテレビアニメ化が発表され、同年10月から12月にかけてテレビ東京系列他で放送されていた。詳細はテレビアニメ「ミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜」を参照。

2009年9月18日から10月17日の間、実際に大江戸線内でテレビアニメの絵柄がラッピングされた車両が走っていた。また9月29日から10月5日の間には、主要キャラクター達のそれぞれの駅他に巨大な番組宣伝ポスターが貼られていた。その後、12月22日から2010年1月11日にかけて『大江戸線☆モバイルラリー』と題して、主要キャラクター達のそれぞれの駅に巨大な番組宣伝ポスターが貼られていた。

2010年12月に舞台版が上演された。詳細は舞台「ミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜」を参照。

「中央線版のキャラクター」、「大江戸線版のキャラクター」という括りは特に無いゲストキャラクター達。

国際展示場 正門（こくさいてんじじょう まさかど）

声 - 高橋直純
身長178cm、血液型B型。
大江戸線版ウェブコミック第2話に登場。2009年夏にコミックマーケット内で行なわれたイベントで初登場し、その後は何かしらのイベントが行なわれるたびに出現するキャラクターとなっている。明るく勝ち気な性格で、雑学に詳しく最先端の知識がある。
大型イベント会場東京国際展示場の最寄り駅である、国際展示場正門（ゆりかもめ）と国際展示場（りんかい線）の擬人化。

幕張 海（まくはり かい）

声 - 斎賀みつき
身長180cm、血液型O型。
大江戸線版ウェブコミック第2話に登場。2009年夏にキャラホビで行なわれたイベントで初登場し、その後は何かしらのイベントが行なわれるたびに出現するキャラクターとなっている。スポーツ選手の父とフランス人の母を持つ。スポーツ万能でアウトレットモールでの買い物が好き。
大型イベント会場幕張メッセの最寄り駅である、海浜幕張（京葉線）を含む幕張新都心の擬人化。

五反田 ミコト（ごたんだ ミコト）

声 - 保志総一朗
1968年11月15日生まれ、身長165cm、血液型A型。
『アニメディア』2009年10月号に登場。双子の妹メガミがいる。心は永遠の中学生だが、見た目は童顔高校生。昼は学校へ行き、夜は焼き鳥屋でバイトをしている。
アニメ情報誌『アニメディア』の編集部所在地である五反田（都営浅草線）の擬人化。

五反田 メガミ（ごたんだ メガミ）

声 - 水橋かおり
1968年11月15日生まれ、身長167cm、血液型AB型。
現在どの媒体にも未登場。双子の兄ミコトがいる。アニメ情報誌『メガミマガジン』でグラビアアイドルをしている。最近、メイド喫茶のバイトも始めた。
『メガミマガジン』の編集部所在地である五反田（都営浅草線）の擬人化。駅の擬人化では、現在唯一の女性キャラクター。

新宿三丁目（しんじゅくさんちょうめ）

大江戸線版ウェブコミック第1話に1コマのみ登場。新宿駅都営ファミリーとして一括りにされたため登場した。
新宿三丁目（都営新宿線）の擬人化だが、ファーストネームは不明。

池袋 太陽（いけぶくろ たいよう）

声 - 櫻井孝宏
身長184cm、血液型O型。
東京の三大副都心のひとつ池袋の擬人化。

大江戸線の各駅が乗車している電車。外観は通常の大江戸線の電車と同じく、12-000形の4次車を採用している。しかし内観は1次車を採用している。これは1次車好きな車掌（12号）が、4次車の内装を改造しているためである。先頭車両は1両丸ごと車掌室になっており、車掌（12号）ととくがわと六本木と月島以外その内部を知る者はいない。しかしテレビアニメ第7話において車掌（12号）がバスローブ姿で車掌室から出てきたことから、風呂があるらしいという事だけは分かっている。さらに同最終話において六本木と月島が車掌室に入ったシーンがある

悩みを持った淑女が乗り込んだ場合、その悩みが解決されない限り降りることが出来ない（これは誤って男性が乗車した場合も同様）。しかし駅達と一緒ならば、降りて実際の駅周辺を散策することも可能である。その後、悩みが解決されて1人で降車する際に乗客は自動的に乗車したときの時間に戻される。すなわち通勤途中など急いでいる乗客でも時間をかけて悩みを解決することができる。「一生に一度会えるか会えないか」と言うほどに珍しい電車であり、それが奇跡の電車と言われる所以である。

なお、「ミラクル☆トレインに遭遇した」などの言動を他人の前で行なう事は車掌（12号）によって固く禁じられている。

「ミラ☆コレ 〜ミラクル☆トレイン アニメDVD&ドラマCDスペシャルコレクション〜」として、2009年8月17日にコミックマーケット76の企業ブースで発売された。イントロダクションアニメDVDとドラマCDがセットになっている。

このイントロダクションアニメDVDは約1分間ではあるが中央線版のアニメ化であり、アニメーションスタッフはテレビアニメ版とは多少異なっている。なおドラマCDはイントロダクションアニメDVDの続きになっている。キャストは中央線版の各メインキャラクター。

大江戸線版のアニメ化作品。2009年10月から同年12月までテレビ東京、テレビ愛知、テレビ大阪他にて放送された。ウェブコミックでは擬人化された駅達しか登場しないが、テレビアニメではほぼ毎回ゲストの女性キャラクターが登場する。このゲストキャラクター達の悩みを解決するという、オムニバス形式で話は進行する。

2009年10月5日より、テレビアニメ公式サイトにて配信が開始された。パーソナリティは六本木史役のKENNと車掌役の藤原啓治。なお、過去配信は3回分までとなっている。ちなみに、SUPER BELL"Zがパーソナリティを勤めているネットラジオ「鉄音アワー」と同様に番組を列車に見立てて配信している。

大江戸線クイズ、鉄子の部屋、フツオタの3コーナーの3つで構成されている。放送時間は30分。ただし最終回のみ55分。大江戸線沿線のグルメを競い2人がクイズ対決をする。鉄子の部屋では淑女、時々紳士の悩み相談、フツオタでは主にアニメの宣伝や投稿者からのアニメの感想などの放送を行っている。なお、最終回のみアニメイト横浜店にて公開録音された。

舞台版『ミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜』

2010年12月8日から15日にかけて全労済ホールスペース・ゼロにて全12公演が行われた。

舞台版『ミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜』2nd approach

2012年4月13日から22日にかけて全労済ホールスペース・ゼロにて全15公演が行われた。

『夜のミラクル☆トレイン〜大江戸線へようこそ〜 Sweet Dream Express』

2012年12月28日から30日にかけて新宿FACEにて全6公演が行われた。

ミラクル☆トレインのアバター衣装がYahoo!アバター、ちぷやタウンといったコミュニティにて利用することができている。