御色町（ごしきちょう）という平和な街に、一風変わった個性派揃いの家族・吉永家が住んでいる。

ある日のこと、吉永家の長女・双葉が商店街の福引で三等賞を引き当てた。その賞品は、喋る犬の石像。その日を境に、吉永家と周囲の生活は一変する。その石像は自らを門番と名乗り、頼まれもしないのに吉永家の門柱の上に陣取って訪問者に誰何し、時に問答無用で新聞配達や近所の者に攻撃を仕掛けだす。近所迷惑な石像の行動に双葉は激怒。何とかして石像を排除しようと動き出す。しかし石像は、そんな双葉を始めとする吉永家の人々との触れ合いの中から、自らの行動の善悪や判別・程度を学び、少しずつ町の人々の理解を得て、やがては御色町の守護者として信頼を勝ち得ていく。

石像は、やがて吉永家の人々からガーゴイルと名付けられ、自らの大事な「家族」である吉永家を守るため、また自らに降りかかる火の粉を払うため、主人である双葉や、その兄である和己と共に、時に自らの創造者の1人である高原イヨのサポートを受けながら、様々な敵や困難と戦うことになる。

それなりに平和な猪崎市（いのさきし）の中でも「ちょ～っとだけ」治安の悪い繁華街。その片隅に建築つ雑居ビル逸色ビルの3階に住む東宮ひかるは、実家から家出同然に自立したばかりの見習い錬金術師である。ひかるは、自らの命を分けて創造した自動石像ガーゴイル（通称・ガー助）と共に「人々の役に立つ錬金術師」になるため、自宅をオフィスとし探偵業を兼ねた便利屋「鳥屋」を開業した。

ある日、ひかるは同じビルの1階に構える花屋から事件の依頼を受ける事に。しかし、それはひかるの創造した錬金術「ラーの天秤」を狙う古科学者集団・ミズチとの苛烈な戦いの始まりであった。

ひかるは同じビルに同居する人々や、ミズチと思想を違えたがために敵対していた古科学者高原喜一郎と秋里カンジのコンビと共に、ミズチの野望を粉砕すべく立ち向かっていく。

吉永家のガーゴイルを狙う錬金術師。

東宮 天祢（ひがしみや あまね）

声 - 菊池正美
東宮エレクトロニクス若社長で、トーグーグループ総帥次男。26歳。自宅の豪邸には多数のハウスメイドを従えている。祖父の遺志を継いで錬金術師となり、ケルプを以ってイヨに挑戦した。
美男子な上に優秀な経営者で、錬金術師としても一流、更には家事までこなせる完璧人間だが、イヨには尻に敷かれている。
ひかるにとっては錬金術の師匠であり、天祢としても一番弟子かつ東宮の錬金術の最も年若く可能性に満ちた継承者として、また単純に姪として、ひかるを可愛がっている。時にそれが行き過ぎなほどの姪バカを発揮。これが原因で大恥をかいたり心的なダメージを喰らう。

ケルプ

声 - 岡野浩介
ガーゴイルに対抗するため、東宮天祢によって作られた「上位2級の天使」の名を持つ全身純金製の自動石像。羽根の生えた獅子のような姿をしている。見えざる水銀での光線に加え、相手の心理から姿を隠す心理ステルス機能を持つ。また、ガーゴイル対策に音波を交えた衝撃波を使用した。礼儀正しい性格で誰に対しても敬語でしゃべる。

ハミルトン

声 - 家中宏
スコットランドの錬金術師。痩せ型の中年男性。ガーゴイルに使われている賢者の石を高原イヨから奪うために日本に来た。梨々の父親でもあるが、彼女を錬丹術の被験体にする（成功した暁には人間を超えた存在になる）ことこそが、父親としての愛情だと考えているマッドサイエンティスト。
イヨと天祢が名前を知っていることから、錬金術の世界では多少名の通った人物のようである。原作13巻で再登場し、ピクシーに関する情報を提供する。
アニメ版では梨々を取り戻すためにレイジと結託し、最終話の中ボスとして登場。ケルプやオシリスを奪い操って御色町を襲い、吉永家に挑む。

デュラハン

声 - 飯島肇
ハミルトンが開発した、対立てこもり犯用の城門破りロボット（自動人形）。通称「首無し騎士」で、文字どおり首から上がない（名前の由来もアイルランドの伝承から）。梨々を守ることが主な役目。もともとはハミルトンからの命令だが、現在ではそれを自らの使命と心得ている。百色がハミルトンから梨々の養育権を奪ったあと、今まで彼女にひどいことをした罪滅ぼしをしたいとついてきた。梨々を養うため百色と雇用契約を結び、彼の仕事の手助けをする。料理もできる。未完成な妖精の技術を思考回路に流用されているため、単純な単語での会話しか行えず、性格は少し子供っぽい。
能力は凍結効果のある光線や熱光線の発射、両手部分の銃火器（通常弾頭のほか焼夷弾や榴弾など多種類の弾頭が仕込まれている。また、さまざまなアタッチメントに取り替えることも可能）など。また腹部には奥の手として高熱を帯びる杭が内蔵されており、これを展開した状態での突撃（ヒートパイルアンカー）はガーゴイルでも避けられず、体にヒビを入れるほどであった。

ヒッシャム

声 - 中國卓郎
エジプト人の錬金術師。自国の繁栄と自らの名誉の為にオシリスを開発し、ガーゴイルと対決させようと来日した。英語交じりの日本語を操るが、発音といい文法といいどちらもかなり怪しい不審人物。しかし本当は生命を大切にする心優しい性格。趣味はバレエ鑑賞。変な踊りを常日頃から繰り返している。特技は、円周率を二千五桁まで暗唱できること。語尾に「――デース」を多用する。
実は植物学の権威であり、その業界では表（科学としての植物学者）にも裏（錬金術師・古科学者としての植物学者）にも名の知れた人物。自国に数多くの生徒を残しており、生徒たちからは崇敬を集めている。また「植物は愛情を持って育てねばならない」を第一義の信念としており『おるたなてぃぶZERO』では、その信念の元、教えから外れてミズチに与した弟子を叱責し改心させた。同時に弟子と同道していた古科学者も彼の言葉で同様に改心の道へと至る。
『おるたなてぃぶ』でもレギュラーキャラクターを務め、同作ではひかるの開発の爆発に巻き込まれたり、ひかるに命を50%も吸われたり、ひかるに命がけで新素材を作らされたり、と良い人ぶりが祟って散々な目に合わされている。しかし上記の弟子への説教、植物学系の古科学者の改心、千秋や彦左衛門の治療などを行い、ひかるたちの勝利へと貢献した、本作最大の影の功労者でもある。
なおアニメでは吉永家のガーゴイルの事を「ガゴイールさん」と間違った呼び方をするが、原作ではその表記は一度もない（後に登場した彼の弟子が、吉永家のガーゴイルをこの表記で呼称している）。

オシリス

声 - 浅野るり
ヒッシャムが開発した強化植物。自立が可能なほどの知能を持ち、高飛車な性格。ガーゴイルすら溶す強力な腐食光線、葉が1枚でも残っていれば復活できる強靭な再生能力を持つ。声帯は持たず、会話はもっぱら携帯電話の音声やメールまたは筆談で行う（和己とはメル友である）。元々は食用として開発されたため、果物のような味で美味。体内に万能薬（パナケア）を循環させているため、回復効果もある。名前の由来は一度死んで後に蘇ったというエジプト神話の神から。

イヨの親族や知人。

高原 潤（たかはら じゅん）

兎轉舎の前身である零細輸入商社「高原商会」の主人。イヨの夫であり、喜一郎の父。物語本編時点では故人とされている。本編では、イヨの夢（思い出）の中で同商会の若旦那かつ錬金術を極めんと願う学生として登場した。敬愛する「センセイ」の影響によって「錬金術で人の役に立つ」事を信条とし、そのために一家の安全を守る門番型自動石像の開発を志す。ガーゴイルの開発者の1人であり開発計画の発起人。「見えざる水銀」と「触れざる硫黄」を見出し、ガーゴイル（門番型自動石像）開発の基礎理論を構築した。
テンションが上がるとふんどし一丁の姿となって商品の開発を行う変人。両親が輸入した物品や書物から錬金術の存在を知り、独学でこれを修めた、本作における日本人最初の錬金術師でもある。
イヨと結婚し、一子である喜一郎を儲けるも、日中戦争に端を発する時代の激動に飲み込まれて徴兵され、出征した満州をさらに越えたシベリアで部隊が全滅。そのまま消息を絶ち生死不明。

高原 喜一郎（たかはら きいちろう）

イヨの息子であり、古科学者。外見は軍服を着た少年だが、年齢的には既に老人である。太平洋戦争で戦死したと思われていたが、実は戦争中にイヨの渡したお守り（賢者の石のオリジナル）と魔法使いの手によって不老不死（周囲の時間が喜一郎を覚えている状態）となり、世界中を放浪していた。『ガーゴイルおるたなてぃぶ』では「身体の一部（右手だけ）から完全復活する」「血を飲ませた人間の心臓を再生させる」という荒業を披露したが、本人は“普通の身体に戻りたい”と願っている。
戦争の果てに戦後復員を果たすも、戦後復興の混乱の中で幼馴染であったユキの死と母親であるイヨの生死不明を目の当たりにしてショックを受ける。さらには両親の知人であった平賀に錬金術で創造された特攻兵器を見せられ、父に教えられていた「錬金術で人を幸せにする」という信念が矛盾だらけの詭弁（もっと穿った言葉を使えば「嘘」）であったと誤解する。この事により「錬金術では誰も幸せには出来なかった」と錬金術を憎み、平賀の導きにより古科学に傾倒。錬金術の殲滅を画策し、ガーゴイルと戦うため御色町に現れた。
光るクナイを投げつけ敵を惑わしたり、空中で静止したり、姿を消したりと奇妙な技で戦う。また、剣術の達人でもあり、ケルプを切断しガーゴイルにも太刀傷を負わせた。しかし一連の騒動の後、母の生存を知る。この事で他の古科学者と連携を取ろうとして『おるたなてぃぶ』における一連の事件に巻き込まれ、カンジと共に失踪した古科学者を捜し各地を旅していた。最終的には自らがミズチおよびその前身となる古科学者たちに陥れられていた事を知り、絶望するも「錬金術も古科学もあくまでも道具であり、技術が悪い訳ではなく、使う人間の心次第なのだ」という境地に至る。ひかるやカンジ、平賀の娘などとの付き合いから、自分の女運の無さを気にしているようである。
双葉からは「キー兄ちゃん」と呼ばれている。一連の事件を経て己に決着をつけるため、再び訪れた御色町では和己に驚かれるほど丸い性格になっていた。

秋里カンジ（あきさと カンジ）

フード付きのコートを羽織り、和風の隈取のされた仮面を付けた子どもの古科学者。喜一郎とコンビで行動している。
特殊な折り紙を 通信手段(折鶴)や武器(手裏剣等)として使う。本編9〜10巻の巻頭漫画にて梨々と戦闘したが敗退。父の形見である仮面を盗まれてしまい、それ以来百色一家について調べていた。
『おるたなてぃぶ』3巻（梨々との再戦）にて実は「ボク少女」であったことが判明する。「カンジ」という名前は父親から受け継いだもの。それ以前の名前は不明。同書にて「本編」と『おるたなてぃぶ』のイラストでは体の大きさが違う（成人男性と少女くらい）ことが指摘されているが、イラストレーターの日向悠二は「古科学的秘術を用いた巧妙なだまし絵」と説明している。

センセイ

ガーゴイルを創造した「3人の錬金術師」（イヨ・潤・雅臣）の知人。特に潤と雅臣は彼を恩師として扱っている。岩手県に在住する農学者にして童話作家。かつては花巻の農学校で教師をしていた。「論理的な農業で人を豊かにする」ことと「芸術（童話）で人の心に潤いを与える」ことを自らの理想とし、そのため一農家として自らの農学理論に基づく農業を実践していた。その思想は潤に深い影響を与え、彼の錬金術開発の行動原理・規範となる。その意味では本人は錬金術師ではないものの、この世界における日本の錬金術師たちに根幹たる正しい思想と理想を与えた存在と言える。幼い頃の喜一郎にも「大事な人の『しあわせ』を守れる人になれ」と訓じ、常に自らよりも他者の幸せを願い大事にする、心優しい人物であった。
志半ばで結核に倒れ、学者としても農業者としても童話作家としても無名のままで他界してしまったが、その業績と思想は死後に高く評価され、現在では愛した故郷に記念館まで建てられている。
本文中では、本名はあえて記されず常に「センセイ」と呼称されており、史実上のモデルとは似ても似つかぬ大柄な熊男のように表記されているが、モデルは宮沢賢治である。そのため双葉や和己はセンセイの本名を知った時に、またカンジは喜一郎がセンセイの知人であったことを知った時に、それぞれ仰天している。

• 田口仙年堂（著） / 日向悠二（イラスト） 『吉永さん家のガーゴイル』 エンターブレイン〈ファミ通文庫〉、全15巻
• 2004年2月4日初版発行（1月23日発売）、ISBN 4-7577-1701-6
• 2004年3月31日初版発行（3月19日発売）、ISBN 4-7577-1788-1
• 2004年6月3日初版発行（5月22日発売）、ISBN 4-7577-1871-3
• 2004年9月3日初版発行（8月23日発売）、ISBN 4-7577-1967-1
• 2004年11月1日初版発行（10月20日発売）、ISBN 4-7577-2033-5
• 2005年2月1日初版発行（1月20日発売）、ISBN 4-7577-2133-1
• 2005年5月2日初版発行（4月20日発売）、ISBN 4-7577-2251-6
• 2005年11月10日初版発行（10月29日発売）、ISBN 4-7577-2488-8
• 2006年4月11日初版発行（3月30日発売）、ISBN 4-7577-2663-5
• 2006年5月10日初版発行（4月28日発売）、ISBN 4-7577-2742-9
• 2006年11月10日初版発行（10月30日発売）、ISBN 4-7577-3000-4
• 2007年5月10日初版発行（4月28日発売）、ISBN 978-4-7577-3503-3
• 2007年11月9日初版発行（10月29日発売）、ISBN 978-4-7577-3793-8
• 2008年6月11日初版発行（5月30日発売）、ISBN 978-4-7577-4230-7
• 2008年8月11日初版発行（7月30日発売）、ISBN 978-4-7577-4333-5
• 田口仙年堂（著） / 日向悠二（イラスト）、エンターブレイン〈ファミ通文庫〉、全5巻
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ』2006年8月10日初版発行（7月29日発売）、ISBN 4-7577-2866-2
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ2』2007年1月29日発売、ISBN 978-4-7577-3325-1
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ3』2007年7月30日発売、ISBN 978-4-7577-3631-3
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ4』2008年2月12日初版発行（1月30日発売）、ISBN 978-4-7577-3978-9
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶZERO』2009年1月30日発売、ISBN 978-4-7577-4648-0

• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ』2006年8月10日初版発行（7月29日発売）、ISBN 4-7577-2866-2
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ2』2007年1月29日発売、ISBN 978-4-7577-3325-1
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ3』2007年7月30日発売、ISBN 978-4-7577-3631-3
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶ4』2008年2月12日初版発行（1月30日発売）、ISBN 978-4-7577-3978-9
• 『ガーゴイルおるたなてぃぶZERO』2009年1月30日発売、ISBN 978-4-7577-4648-0

• 田口仙年堂（著） / 日向悠二（イラスト） 『吉永さん家のガーゴイル』 エンターブレイン〈ファミ通文庫〉、2014年2月15日初版発行（同日発売）、ISBN 978-4-04-631381-2

• 『コラボアンソロジー1 狂乱家族日記』2008年8月30日発売、ISBN 978-4-7577-4372-4
• 「御色町狂乱捕物日記」（ファミ通文庫SP『FBSP vol.3 狂乱家族日記すぺしゃる』掲載）および日日日による「狂乱!ガーゴイル日記2054」」（ファミ通文庫公式サイト『FB Online』掲載）を収録
• 『コラボアンソロジー2 “文学少女”はガーゴイルとバカの階段を昇る』2008年11月11日初版発行（10月30日発売）、ISBN 978-4-7577-4484-4
• 「天栗浜のガーゴイル」（ファミ通文庫公式サイト『FB Online』掲載）を収録
• 『コラボアンソロジー3 まじしゃんず・あかでみい』2009年2月12日初版発行（1月31日発売）、ISBN 978-4-7577-4581-0
• 「吉永さん家の☆まかでみい 門番なんですけど。」（書き下ろし）を収録

• 「御色町狂乱捕物日記」（ファミ通文庫SP『FBSP vol.3 狂乱家族日記すぺしゃる』掲載）および日日日による「狂乱!ガーゴイル日記2054」」（ファミ通文庫公式サイト『FB Online』掲載）を収録

• 「天栗浜のガーゴイル」（ファミ通文庫公式サイト『FB Online』掲載）を収録

• 「吉永さん家の☆まかでみい 門番なんですけど。」（書き下ろし）を収録

• 『吉永さん家のガーゴイル アニメすぺしゃる』2006年11月10日初版発行（10月30日発売）、ISBN 4-7577-3003-9
• アニメ全13話のシナリオに加え書き下ろし短編を収録

• アニメ全13話のシナリオに加え書き下ろし短編を収録

日向悠二と玉岡かがりの2名によって、別々に描かれた。

• 原作 - 田口仙年堂
• 監督 - 鈴木行
• シリーズ構成・脚本 - 吉岡たかを
• キャラクター原案 - 日向悠二
• キャラクターデザイン・総作画監督 - 渡辺真由美
• 美術監督 - 松平聡
• 色彩設定 - 山口喜加
• 撮影監督 - 三品雄介
• 編集 - 坂本雅則
• 音響監督 - 飯塚康一
• 音楽 - 大谷幸
• プロデューサー - 赤堀悟、高畑裕一郎、大宮三郎
• アニメーションプロデューサー - 光延青児
• アニメーション制作 - トライネットエンタテインメント、スタジオ雲雀
• 製作 - 御色町商店街（エンターブレイン、エイベックス・エンタテインメント、トライネットエンタテインメント、ハピネット・ピクチャーズ）

• ドラマCD「吉永さん家のガーゴイル ガーくんドキドキ三本勝負」（2006年4月26日、AVCA-22717）
• OPテーマ「オハヨウ」とEDテーマ「愛においで 逢いにおいで」のTVsizeを、主題歌CDに先行して収録。
• ドラマCD第1話「吉永さん家の和己くん」、第2話「第一小のガーゴイル」、第3話「お姉さん家の青龍刀」を収録。
• ドラマCDは、原作の田口仙年堂監修。
• アニメには未登場の、夜倶先生も登場した。
• ジャケットは、日向悠二描き下ろし。
• 初回特典として、特製カードが封入された。
• OP&EDテーマ オハヨウ/愛においで 逢いにおいで（2006年5月24日、AVCA-22758）
• 吉永さん家のガーゴイル キャラクターソングシリーズ（2006年7月5日、AVCA-22826～22828）
• 各キャラクターのキャラクターソングとそのInstrumental、EDテーマ「愛においで 逢いにおいで」のソロバージョン、おまけメッセージを収録。
• 初回特典として、日向悠二描き下ろしアナザージャケットが封入された。
• ｢答えは空の下｣（双葉（斎藤千和））
• ｢Promise you｣（梨々（水樹奈々））
• ｢Dear my Friends｣（美森（稲村優奈））
• 吉永さん家のガーゴイル 御色町おんがく祭り（2006年5月24日、AVCA-22789（AVCX-22789））
• 吉永双葉役の斎藤千和と吉永和己役の宮田幸季による、「現場タレコミミニ番組」と称したラジオ風ドラマや、アフレコ裏話、BGMなどを収録。
• 初回特典として、怪盗百色モデル 特製トランプのジョカーその1が封入された。
• 吉永さん家の玉手箱（2006年5月24日、AVCA-22938）
• 全24曲を収録した音楽CDと、PC用デスクトップアクセサリー集を収録。
• デスクトップアクセサリー集には、デスクトップ用デジタル時計5種と壁紙4種、スクリーンセイバー1種、アイコン12種のほか、日向悠二による4コマ漫画no.4～33を収録。
• 初回特典として、怪盗百色モデル 特製トランプのジョカーその2が封入された。

• OPテーマ「オハヨウ」とEDテーマ「愛においで 逢いにおいで」のTVsizeを、主題歌CDに先行して収録。
• ドラマCD第1話「吉永さん家の和己くん」、第2話「第一小のガーゴイル」、第3話「お姉さん家の青龍刀」を収録。
• ドラマCDは、原作の田口仙年堂監修。
• アニメには未登場の、夜倶先生も登場した。
• ジャケットは、日向悠二描き下ろし。
• 初回特典として、特製カードが封入された。

• 各キャラクターのキャラクターソングとそのInstrumental、EDテーマ「愛においで 逢いにおいで」のソロバージョン、おまけメッセージを収録。
• 初回特典として、日向悠二描き下ろしアナザージャケットが封入された。

• 吉永双葉役の斎藤千和と吉永和己役の宮田幸季による、「現場タレコミミニ番組」と称したラジオ風ドラマや、アフレコ裏話、BGMなどを収録。
• 初回特典として、怪盗百色モデル 特製トランプのジョカーその1が封入された。

• 全24曲を収録した音楽CDと、PC用デスクトップアクセサリー集を収録。
• デスクトップアクセサリー集には、デスクトップ用デジタル時計5種と壁紙4種、スクリーンセイバー1種、アイコン12種のほか、日向悠二による4コマ漫画no.4～33を収録。
• 初回特典として、怪盗百色モデル 特製トランプのジョカーその2が封入された。