相米監督の演出ノートには「海ーあるときはゆったりと大きくうねりあるときは激しく幾重にも噛む。人生ー別離の連続であり別れこそが人間が生きていることの証である。『魚影の群れ』は大海原の孤舟に立ってみつめる愛と闘いのドラマです」と書かれてあった。

相米作品の常連俳優・寺田農は緒形を取り調べる刑事役で出演し、さんざん苦労して撮ったのに、長いという理由で丸々カット。クレジットで名前が表記されるため、テレビ放映されると知人から「どこに出てたんですか、テレビ放映でカットされたんですね?」と言われるが最初から出演シーンはない。『光る女』もリポーター役での出演だったが、同様に全カットされ、『台風クラブ』は特殊メイクに3–4時間かけたが、ロングのワンカットだけにされたという。

青森県下北郡の漁港・大間町でオールロケ。

夏目雅子が『キネマ旬報』1983年4月下旬号のインタビューで、このあと『魚影の群れ』の撮影に入ると話しており、『サンデー毎日』1983年5月8、15日号の青島幸男との対談では「2度手術をして昔はウォッカをボトル一本ぐらい飲めたの今は3杯くらいで酔っぱらう、調子も悪く今年の3月に突然ジンマシンが出た、仕事も立て続けで今は『魚影の群れ』を撮っている」などと話していることから、1983年春から撮影に入り、後述する『週刊平凡』の記事から1983年春から夏まで、あるいは秋まで撮影をしたものと見られる。津軽海峡を渡るマグロは、ある時期しか回遊していかず、マグロを追いかけ、8月いっぱいくらいまでずっと海に出た。最後はもう大間では撮れないと判断され、北海道にまで行った。このため撮影は1983年9月初めまでやった。

夏目は1983年夏に、本作、『瀬戸内少年野球団』、NHK大河ドラマ『徳川家康』の3本を掛け持ち。青森、瀬戸内、東京、京都と、体の調子が悪いのにも関わらず、北から南へロケ・スタジオ撮影に駆け巡った。『週刊平凡』1983年9月1日号では「今年の話題作ゼーンブに出演している超多忙女優 夏目雅子 『もう、なんだか旅役者みたいな感じ…』というタイトルで、夏目の1983年夏のスケジュールを紹介している。7月7日～15日、青森県下北半島大間崎『魚影の群れ』ロケ。7月16日～23日、東京NHK大河『徳川家康』録画、7月24日～28日、京都『瀬戸内少年野球団』セット撮影、7月31日、京都カネボウCM撮り。8月4日～9日、兵庫県淡路島『瀬戸内少年野球団』ロケ、8月10日～11日、岡山県真鍋島、8月12日、香川県高見島『瀬戸内少年野球団』ロケ、8月13日～17日、東京『徳川家康』録画、8月18日～24日、青森県大間崎『魚影の群れ』ロケ。「自分を切り換えるのが、次の現場に移動するときだけで、演じていて役柄を混乱している。まだ女優というちゃんとした位置を与えられているとは思っていない。ただ、いい作品に出させていただいているというだけ。今は夏目雅子という名前に、体も精神もついていってなく不安定」などと話した。

夏目は本作の出演経緯を「都会で生きるってのもそれはそれで大変なんだけど、漁村とか農村の人は自然を相手に仕事してるわけで、自分の意志ではどうにも出来ないものと闘ってるわけだから、すごく逞しいし、強いし、土くさくていいなあと思ってたんですね。たまたま去年（1982年）、行商のおばさんのドキュメンタリーをTVで見て、すごく感動しちゃって、何かそういう土くさいところで生活している人に触れたくなって仕方なかったんです。せっかく女優という仕事をさせて頂いてるんだから、そういう役をやることで容易だけど、何か気持ちに触れることが出来るんじゃないかと思ったところへこの漁村の人の役が来たのでうれしくて」と述べている。

同時期の撮影だった『魚影の群れ』と『瀬戸内少年野球団』があまりにも違い、『魚影の群れ』がおじさんばかりに比べて『瀬戸内少年野球団』では大好きな子どもたちに囲まれ、風呂に入ったり、花火大会をやったりし、ホッと出来たと話している。また『瀬戸内少年野球団』の篠田正浩監督の印象を「必死になって芝居を見てくれます。役者の動きに合わせて、監督もカメラの後ろで思わず体を動かしたりして。こういう現場にいることがいまうれしくて仕方ないんです」と話したのとは対照的に、相米慎二監督を評して「もうめちゃくちゃしごかれてるんです。この前なんか、ワンシーン撮るのに、夜の7時から明け方の4時まで、ぶっ通しで粘るんですよ。もうメークははげるし、目にクマはできるし…。それなのに私なんか"粗大ごみ"なんて呼ばれてるんですよ。アタマにきて"ハゲ！"とか"陰気！"とか悪口いうんだけど、黙ってニィーッと笑ってるだけ。ブキミですよ、だから私、"変態仙人"ってアダ名つけてやったんです。マジに憎しみをいだいてるんです。いつか海の中に叩き込んでやりたいとスキを伺ってるの。ウフフフ」、「相米監督がさあ、私にイメージじゃない、って言うの。夏目さんは洗練され過ぎていて、漁師の娘に見えない、って。イメージじゃなきゃあ、最初からキャスティングしなきゃいいじゃない。なのに毎日畳の上に正座させて説教するんだけど急に変わるわけないよね。親がそういう風に育てなかったのに、今更言われてもしょうがないでしょ、って言ったの。でも、相手は監督だからしょうがない、毎日付き合ってあげたけど、あまり頭よくないよね」などと批判した。相米は夏目に対して「もう一度あいつとやりたかった」としきりに言っていたと言われる。

デビューして以降、"お嬢さん"と呼ばれ、ことあるごとに「お前はハングリーじゃないからダメなんだ」と言われ続けた。夏目の代名詞ともなった『鬼龍院花子の生涯』の台詞「なめたらあかんぜよ!」は、「あの頃の私の気持ちに本当にピッタリだった」と話している。

緒形拳は夏目を評して「雅子には喉元に凄絶な傷痕がある。あれを曝け出して芝居するようになったら、怖い役者になるよ」と評した。

緒形は1ヶ月前に現場に入って大間に住み込み、マグロ一本釣り漁師から指導を受けた。また他の出演者も地元の人たちの交流を持ち、地元言葉（下北弁）を習得した。緒方がもう出来上がっている状態で夏目は現場入りし、3本の掛け持ちで大間の女にならないといけないという焦りから円形脱毛症になった。それを「禿げた禿げた！」と皆に言って周った、相米の演出にも慣れず、スタッフも最初のうちは「都会のお嬢さんが漁師の娘をできるのかなぁ」と思っていたというが、勘の良さと本能的な芝居の掴み方ができる人でこれをこなした。

相米組に初参加の佐藤浩市は、撮影初日が夏目との喫茶店のシーン。朝から現場に入ると「じゃあ今からおまえらやってみろよ」とテストを始めたが「駄目、もう一回」「駄目、もう一回」とどこが悪いかも言わず、何度もテストを繰り返し、結局初日はカメラが回らず。佐藤も夏目の相当落ち込んだ。次の日もテストを繰り返し、午後からようやくカメラが回った。役者を始めて2–3年の頃で、ビックリしたという。「今の撮影スケジュールだと無理でしょうね」と話している。

カメラの長沼が相米監督に事前に松竹の下の喫茶店で「船の上で長回しってどうする?」と聞いたら「俺にもわからないんだよなあ」と言った。緒形が乗る第三登喜丸と佐藤が乗る第一登喜丸と、もう一つキャメラ船というその二つの倍ぐらいの船のクレーンを釣り出して主に撮った。何度もぶつかりそうになる命懸けの撮影。単純にクレーンだけだと怖いため、鳥かごのような鉄のかごを作ってそれをぶら下げた。その中にキャメラマンとその助手が乗った。助手が乗らないとフォーカスが出来ないためで、津軽海峡の波が凄く3回ぐらい死にかけたという。

マグロは釣れなかった時のために電動の作り物のマグロを用意していたが、相米監督が実際にマグロが釣り上がるまで撮影をネバリにネバり、その執念が実り、緒形拳がガチでマグロを釣り上げた。役者はみな力演し勿論いいが、マグロ釣り上げシーンがそれらを凌駕する。マグロもわざとらしくハネたり暴れたりせず、水面下で右往左往する姿が一層臨場感を漂わせる。

撮影の長沼六男は「『魚影』は本当に大変だった。若かったからやれたけど、もうできない。俺も相米さんもまだ40歳前だったしね。青函トンネルを掘っていた時期で、海の中に音が響いていて、マグロが捕れなかったんです。結局マグロを追いかけて北海道まで撮影に行ったけど、今（2011年）はまた捕れるんだってね。船の撮影は前田陽一監督の『土佐の一本釣り』でも経験していたけど、あんなむちゃくちゃはしなかった。カメラ船にクレーンつけて、その先に檻みたいなのを下げてその中でカメラ回したんだ。ぶら下げているのは、水平をとるためなんだけど、波で船が傾くと極端に上がったり、下がると海に入るし、『俺、何してるんだろう（笑）』って。皆船酔いで撮影現場に着くまで寝てた。港だから魚は豊富なんだけど、ずっと船に乗ってると匂いが鼻について、魚なんか食べたくならないの。旅館のおばちゃんが『何食べたい』って聞いてくれて近くの農家からもらってきてくれたキュウリが唯一おいしかった。夜が明ける前にカメラを取り付けるんだけどそれが1–2時間かかる。ちょうど身体が冷え切ったところで、夜明けとともに撮影に出るから本当に寒かった。でも『魚影』があったから、俺はこうしていられるのかもしれない。相米さんに出会えて幸せだったかな。あれがなかったら、どうなんだろうね」などと述べている。

カット数は90前後。相米演出の特徴として著名な長回し（ワンシーンワンカット）の手法が特に前半に連続して行われる。タイトルロールからのクレーン撮影で、荒れた海→パン→砂浜の足跡のアップ→上昇→パン→アップは、本来相米がイメージしていた演出プランは「大間の沖をカモメの大群が飛びながらその下の海にはマグロの群れが走るのを空撮しながら、カメラが魚影からずれて海岸の砂山に佐藤と夏目」というものだった。今日ならデジタル処理でわけなく出来るが当然当時は無理だった。佐藤は「ただ撮影当時CGで出来ても相米さんはやらなかったと思う。それは確信出来ます。ある意味で相米さんは、もう当時でもあまり見かけなくなっていた、いわゆる"映画屋"の匂いをずっと持っている人でした」などと述べている。

夏目が「涙の連絡船」を唄いながら、自転車で坂道を滑降する長回しは『翔んだカップル』に通じ、緒形拳の元妻で夏目雅子の母・アヤ（十朱幸代）が旅館にいる緒形に気付き、雨の中、逃げる十朱を緒形が追う長回しなどは名シーンとして有名で、助監督の榎戸耕史も「実際僕らも現場で撮ったときは震えがくるくらいでした」と回想している。台本は「一瞬見つめ合い、逃げる妻、追う夫」と二行だけ。十朱は延々と走らされ、「あー終わった」と思ったら相米は「明日も走りの続きを撮ろう」と言い、十朱は3日間走り続けた。相米が「これ以上、走れなくなったら、どうしますか?」と聞いたため、十朱は「もうくたびれ果てているから、逃げ切れないと思って、道路に寝転ぶかな」と言ったら「それ、やってみて」と言った。

ただ5カット目の小浜トキ子（夏目雅子）と依田俊一（佐藤浩市）が橋の上で話すシーンでは、橋の横にカメラが回り込み、川の上に櫓を組んでいるのか、対岸からのクレーン撮影なのかは分からないが、画面が揺れて不安定なカットになっている。また喫茶店で緒形と佐藤が初めて会うシーンで、長回しはいいとしても、狭い室内でのカメラのパンや移動は必要なのかと思える。また佐藤が大間に引っ越して来たアパートでの佐藤と夏目のシーンは中途半端なズームで、室内でのカメラの上下横の移動、ズームの多用は見辛い。珍しいカットとして走行中の車のフロントガラス越しに佐藤と夏目の会話を撮るシーンで、会話の後、カメラが半回転して前方の景色を映すシーンがある。二台の車両を繋げて前の車両から撮影する場合、このようなカメラ割りは通常はやらない。

緒形と十朱が緒形の船の中での濡れ場で十朱が両乳を露出する。十朱は当時「脱がない方の最右翼」と思われていたため、大胆濡れ場とオ〇パイを露出したため、映画関係者も驚いた。意外に大きいことでも驚かれ、映画評論家の北川れい子は「十朱のバストの迫力にはマイったわ。日本女性のバストは仰向けになるとぺチャンとなるのが多いけど、彼女のはポッチャリと"自立"している。いま脱いでいる女優の中で、オ〇パイに関する限り第一級品。乳首も大きく、男性による手入れがよくいき届いているって感じです」と評した。画面が暗くきれいなシャシンでないのは、十朱があそこまで裸になるとは、スタッフにも知らせておらず、照明とカメラと監督だけという少人数で秘密裡に撮影したため。酒の勢いで十朱が脱いだとも言われる。本作以降、十朱はよく脱いだ。

十朱は「30代の終わりに、転機となる作品に出逢いました。『魚影の群れ』です。もう十二分に大人の年齢にさしかかっているのに、相変らず私の役は、清く正しく明るい、隣のお姉さん的な役柄ばかり。同世代の女優さんたちはもっと大人の女の深い演技で評価されているのに、私にはなかなか大人の役が来なかった。やりたいのに、できるはずなのに、と、ジレンマを抱えていたのです。そこに突然舞い込んだのが『魚影の群れ』です。脚本を読むとそれまでやったことのない濡れ場はあるし、当然ヌードにもなる。しかも汚れ役です。お話をいただいたとき、最初は、どうしようどうしようって、思いました。脱がなくちゃならないし、しゃべりながらのベッドシーンが延々と……。それまで大人の女を演じたいとずーっと公言していましたけど、いきなりここまでの役が来るとは……。正直だいぶ迷いましたが、ええい！当たって砕けろだ！と覚悟を決めました。やるからには、今までの私のイメージを覆す必要があります。まずはビジュアルから工夫してみようと思いました...『魚影の群れ』で作品を作り上げていく醍醐味を知りました。自分がどう演じたいのか、イメージを最大限に膨らませる。監督に自分の意見が言えて、それを聞いてもらい作品の一部になっていく。女優になって20年も経っていましたが、初めての経験ばかりでした。それまでの私には、絶対に来ない役で、絶対やらないシーンばかりで、ワンシーン、ワンシーンを積み重ねて、私の出番が埋まっていくたびに、新しい自分が引き出される気がしました。本当に意味のある仕事でした。あの作品をきっかけに、ガラリと役柄の幅が広がったのです。私の、女優という仕事の節目になる、ターニングポイントになった作品です」などと述べている。

佐藤と夏目の濡れ場では夏目は乳房を露出しない。夏目は腰のラインが魅力的なため、意識して後ろ姿を撮っているという。

助監の榎戸は「緒形さんも浩市くんも基本的にマグロありきの芝居なんですよね。マグロと格闘するって、ある意味では『白鯨』ですよ。だけどこれに対抗するために、あの母娘がいるんですよ。北海道での十朱さんの凄まじい芝居と、夏目さんの対抗する芝居がないと、たぶん男たちのドラマも生きてこないんですよ。単純にマグロの話だけじゃなくって、人間ドラマとして成立するのは、夏目さんがちゃんと漁師の緒形さんと堂々と渡り合ってるからだと思うんですよ」などと評している。

全編地元言葉（下北弁）でのセリフ回しで、地元民以外の人から観ると、何を言っているのか分からない箇所も多い。

『映画年鑑 1985年版』には「『魚影の群れ』『この子を残して』は評判のみが先行して興行的には失敗であった」と書かれている。

第57回キネマ旬報ベスト・テン 7位

• 読者選出日本映画ベスト・テン 8位

第7回日本アカデミー賞

• 最優秀主演男優賞：緒形拳（『楢山節考』/『陽暉楼』と合わせて）

第8回報知映画賞

• 主演女優賞：夏目雅子（『時代屋の女房』ほかと合わせて）

第38回毎日映画コンクール

• 男優主演賞：緒形拳（『楢山節考』/『陽暉楼』と合わせて）

第26回ブルーリボン賞

• 主演男優賞：緒形拳（『楢山節考』/『陽暉楼』/『OKINAWAN BOYS オキナワの少年』と合わせて）